Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPRTO14522 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTPRTO14522 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTPRTO14522 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTPRTO14522 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTPRTO14522 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
PTPRTO14522 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTPRTO14522 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
PTPRTO14522 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTPRTO14522 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTPRTO14522 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTPRTO14522 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTPRTO14522 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTPRTO14522 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTPRTO14522 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTPRTO14522 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTPRTO14522 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTPRTO14522 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPRTO14522 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPRTO14522 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPRTO14522 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPRTO14522 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPRTO14522 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPRTO14522 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPRTO14522 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPRTO14522 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPRTO14522 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPRTO14522 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPRTO14522 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPRTO14522 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPRTO14522 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPRTO14522 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPRTO14522 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.08
PTPRTO14522 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.08
PTPRTO14522 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTPRTO14522 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTPRTO14522 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTPRTO14522 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTPRTO14522 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTPRTO14522 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTPRTO14522 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTPRTO14522 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTPRTO14522 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTPRTO14522 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTPRTO14522 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTPRTO14522 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTPRTO14522 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTPRTO14522 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTPRTO14522 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTPRTO14522 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PTPRTO14522 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PTPRTO14522 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PTPRTO14522 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PTPRTO14522 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PTPRTO14522 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PTPRTO14522 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC28■■■□□ 2.07
PTPRTO14522 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PTPRTO14522 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PTPRTO14522 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PTPRTO14522 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PTPRTO14522 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC28■■■□□ 2.07
PTPRTO14522 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC28■■■□□ 2.07
PTPRTO14522 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PTPRTO14522 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PTPRTO14522 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC28■■■□□ 2.07
PTPRTO14522 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PTPRTO14522 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PTPRTO14522 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PTPRTO14522 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTPRTO14522 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTPRTO14522 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTPRTO14522 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTPRTO14522 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTPRTO14522 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
PTPRTO14522 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
PTPRTO14522 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTPRTO14522 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTPRTO14522 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTPRTO14522 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTPRTO14522 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
PTPRTO14522 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
PTPRTO14522 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTPRTO14522 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTPRTO14522 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
PTPRTO14522 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTPRTO14522 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTPRTO14522 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTPRTO14522 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTPRTO14522 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTPRTO14522 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
PTPRTO14522 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTPRTO14522 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTPRTO14522 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTPRTO14522 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PTPRTO14522 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PTPRTO14522 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PTPRTO14522 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PTPRTO14522 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PTPRTO14522 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PTPRTO14522 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
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