Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BHLHE40O14503 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms