Protein–RNA interactions for Protein: E9PMD0

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PMD0 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
E9PMD0 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
E9PMD0 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
E9PMD0 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
E9PMD0 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
E9PMD0 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
E9PMD0 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
E9PMD0 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
E9PMD0 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
E9PMD0 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
E9PMD0 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
E9PMD0 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
E9PMD0 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
E9PMD0 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
E9PMD0 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
E9PMD0 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
E9PMD0 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
E9PMD0 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
E9PMD0 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
E9PMD0 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
E9PMD0 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
E9PMD0 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
E9PMD0 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
E9PMD0 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
E9PMD0 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
E9PMD0 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
E9PMD0 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
E9PMD0 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
E9PMD0 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
E9PMD0 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
E9PMD0 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
E9PMD0 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
E9PMD0 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
E9PMD0 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
E9PMD0 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
E9PMD0 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
E9PMD0 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
E9PMD0 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
E9PMD0 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
E9PMD0 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
E9PMD0 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
E9PMD0 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
E9PMD0 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
E9PMD0 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
E9PMD0 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
E9PMD0 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
E9PMD0 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
E9PMD0 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
E9PMD0 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
E9PMD0 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
E9PMD0 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
E9PMD0 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
E9PMD0 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
E9PMD0 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
E9PMD0 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
E9PMD0 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
E9PMD0 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
E9PMD0 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
E9PMD0 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
E9PMD0 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
E9PMD0 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
E9PMD0 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
E9PMD0 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
E9PMD0 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
E9PMD0 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.02
E9PMD0 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
E9PMD0 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
E9PMD0 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
E9PMD0 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
E9PMD0 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
E9PMD0 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
E9PMD0 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
E9PMD0 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
E9PMD0 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
E9PMD0 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
E9PMD0 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
E9PMD0 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
E9PMD0 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
E9PMD0 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
E9PMD0 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
E9PMD0 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
E9PMD0 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
E9PMD0 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
E9PMD0 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
E9PMD0 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
E9PMD0 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
E9PMD0 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
E9PMD0 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
E9PMD0 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
E9PMD0 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
E9PMD0 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
E9PMD0 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
E9PMD0 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
E9PMD0 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
E9PMD0 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
E9PMD0 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
E9PMD0 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
E9PMD0 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
E9PMD0 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
E9PMD0 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms