Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERVV-2B6SEH9 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ERVV-2B6SEH9 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERVV-2B6SEH9 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERVV-2B6SEH9 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERVV-2B6SEH9 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERVV-2B6SEH9 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERVV-2B6SEH9 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERVV-2B6SEH9 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERVV-2B6SEH9 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERVV-2B6SEH9 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERVV-2B6SEH9 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERVV-2B6SEH9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERVV-2B6SEH9 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERVV-2B6SEH9 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ERVV-2B6SEH9 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERVV-2B6SEH9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERVV-2B6SEH9 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERVV-2B6SEH9 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERVV-2B6SEH9 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERVV-2B6SEH9 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERVV-2B6SEH9 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERVV-2B6SEH9 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ERVV-2B6SEH9 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ERVV-2B6SEH9 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERVV-2B6SEH9 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERVV-2B6SEH9 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERVV-2B6SEH9 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERVV-2B6SEH9 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERVV-2B6SEH9 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERVV-2B6SEH9 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERVV-2B6SEH9 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERVV-2B6SEH9 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERVV-2B6SEH9 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERVV-2B6SEH9 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERVV-2B6SEH9 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERVV-2B6SEH9 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERVV-2B6SEH9 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERVV-2B6SEH9 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERVV-2B6SEH9 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERVV-2B6SEH9 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERVV-2B6SEH9 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERVV-2B6SEH9 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERVV-2B6SEH9 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERVV-2B6SEH9 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERVV-2B6SEH9 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERVV-2B6SEH9 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERVV-2B6SEH9 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERVV-2B6SEH9 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERVV-2B6SEH9 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERVV-2B6SEH9 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERVV-2B6SEH9 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERVV-2B6SEH9 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERVV-2B6SEH9 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERVV-2B6SEH9 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERVV-2B6SEH9 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERVV-2B6SEH9 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERVV-2B6SEH9 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERVV-2B6SEH9 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERVV-2B6SEH9 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERVV-2B6SEH9 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERVV-2B6SEH9 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERVV-2B6SEH9 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERVV-2B6SEH9 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ERVV-2B6SEH9 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERVV-2B6SEH9 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERVV-2B6SEH9 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERVV-2B6SEH9 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERVV-2B6SEH9 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERVV-2B6SEH9 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERVV-2B6SEH9 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ERVV-2B6SEH9 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERVV-2B6SEH9 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERVV-2B6SEH9 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERVV-2B6SEH9 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ERVV-2B6SEH9 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERVV-2B6SEH9 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERVV-2B6SEH9 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERVV-2B6SEH9 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERVV-2B6SEH9 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERVV-2B6SEH9 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERVV-2B6SEH9 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERVV-2B6SEH9 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERVV-2B6SEH9 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERVV-2B6SEH9 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERVV-2B6SEH9 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERVV-2B6SEH9 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERVV-2B6SEH9 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERVV-2B6SEH9 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERVV-2B6SEH9 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERVV-2B6SEH9 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERVV-2B6SEH9 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERVV-2B6SEH9 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERVV-2B6SEH9 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERVV-2B6SEH9 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERVV-2B6SEH9 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERVV-2B6SEH9 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ERVV-2B6SEH9 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERVV-2B6SEH9 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ERVV-2B6SEH9 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms