Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ27

NEURL1B, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL1BA8MQ27 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
NEURL1BA8MQ27 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NEURL1BA8MQ27 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NEURL1BA8MQ27 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NEURL1BA8MQ27 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NEURL1BA8MQ27 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEURL1BA8MQ27 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NEURL1BA8MQ27 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NEURL1BA8MQ27 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEURL1BA8MQ27 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NEURL1BA8MQ27 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEURL1BA8MQ27 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEURL1BA8MQ27 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEURL1BA8MQ27 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEURL1BA8MQ27 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEURL1BA8MQ27 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEURL1BA8MQ27 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEURL1BA8MQ27 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEURL1BA8MQ27 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEURL1BA8MQ27 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEURL1BA8MQ27 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEURL1BA8MQ27 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEURL1BA8MQ27 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEURL1BA8MQ27 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEURL1BA8MQ27 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEURL1BA8MQ27 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NEURL1BA8MQ27 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEURL1BA8MQ27 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEURL1BA8MQ27 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEURL1BA8MQ27 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NEURL1BA8MQ27 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEURL1BA8MQ27 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEURL1BA8MQ27 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEURL1BA8MQ27 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEURL1BA8MQ27 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEURL1BA8MQ27 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEURL1BA8MQ27 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEURL1BA8MQ27 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEURL1BA8MQ27 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEURL1BA8MQ27 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEURL1BA8MQ27 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEURL1BA8MQ27 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEURL1BA8MQ27 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NEURL1BA8MQ27 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEURL1BA8MQ27 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NEURL1BA8MQ27 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEURL1BA8MQ27 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEURL1BA8MQ27 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEURL1BA8MQ27 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEURL1BA8MQ27 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEURL1BA8MQ27 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEURL1BA8MQ27 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEURL1BA8MQ27 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEURL1BA8MQ27 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEURL1BA8MQ27 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEURL1BA8MQ27 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEURL1BA8MQ27 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEURL1BA8MQ27 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEURL1BA8MQ27 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEURL1BA8MQ27 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEURL1BA8MQ27 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEURL1BA8MQ27 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEURL1BA8MQ27 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEURL1BA8MQ27 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEURL1BA8MQ27 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEURL1BA8MQ27 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEURL1BA8MQ27 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEURL1BA8MQ27 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEURL1BA8MQ27 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NEURL1BA8MQ27 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEURL1BA8MQ27 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NEURL1BA8MQ27 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NEURL1BA8MQ27 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEURL1BA8MQ27 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEURL1BA8MQ27 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEURL1BA8MQ27 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEURL1BA8MQ27 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEURL1BA8MQ27 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEURL1BA8MQ27 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEURL1BA8MQ27 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEURL1BA8MQ27 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEURL1BA8MQ27 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEURL1BA8MQ27 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEURL1BA8MQ27 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEURL1BA8MQ27 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEURL1BA8MQ27 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEURL1BA8MQ27 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEURL1BA8MQ27 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEURL1BA8MQ27 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEURL1BA8MQ27 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEURL1BA8MQ27 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEURL1BA8MQ27 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEURL1BA8MQ27 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEURL1BA8MQ27 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEURL1BA8MQ27 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEURL1BA8MQ27 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NEURL1BA8MQ27 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NEURL1BA8MQ27 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEURL1BA8MQ27 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEURL1BA8MQ27 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms