Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
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