Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC169A6NNP5 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms