Protein–RNA interactions for Protein: A6NEY3

GOLGA6L3, Putative golgin subfamily A member 6-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L3A6NEY3 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GOLGA6L3A6NEY3 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GOLGA6L3A6NEY3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOLGA6L3A6NEY3 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOLGA6L3A6NEY3 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOLGA6L3A6NEY3 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOLGA6L3A6NEY3 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOLGA6L3A6NEY3 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOLGA6L3A6NEY3 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOLGA6L3A6NEY3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOLGA6L3A6NEY3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOLGA6L3A6NEY3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOLGA6L3A6NEY3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOLGA6L3A6NEY3 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOLGA6L3A6NEY3 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOLGA6L3A6NEY3 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOLGA6L3A6NEY3 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOLGA6L3A6NEY3 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GOLGA6L3A6NEY3 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOLGA6L3A6NEY3 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOLGA6L3A6NEY3 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOLGA6L3A6NEY3 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOLGA6L3A6NEY3 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOLGA6L3A6NEY3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOLGA6L3A6NEY3 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOLGA6L3A6NEY3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOLGA6L3A6NEY3 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GOLGA6L3A6NEY3 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GOLGA6L3A6NEY3 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GOLGA6L3A6NEY3 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GOLGA6L3A6NEY3 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GOLGA6L3A6NEY3 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GOLGA6L3A6NEY3 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GOLGA6L3A6NEY3 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GOLGA6L3A6NEY3 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GOLGA6L3A6NEY3 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GOLGA6L3A6NEY3 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GOLGA6L3A6NEY3 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GOLGA6L3A6NEY3 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GOLGA6L3A6NEY3 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GOLGA6L3A6NEY3 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GOLGA6L3A6NEY3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GOLGA6L3A6NEY3 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GOLGA6L3A6NEY3 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GOLGA6L3A6NEY3 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GOLGA6L3A6NEY3 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GOLGA6L3A6NEY3 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GOLGA6L3A6NEY3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GOLGA6L3A6NEY3 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GOLGA6L3A6NEY3 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GOLGA6L3A6NEY3 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GOLGA6L3A6NEY3 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GOLGA6L3A6NEY3 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GOLGA6L3A6NEY3 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GOLGA6L3A6NEY3 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GOLGA6L3A6NEY3 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GOLGA6L3A6NEY3 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GOLGA6L3A6NEY3 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GOLGA6L3A6NEY3 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GOLGA6L3A6NEY3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GOLGA6L3A6NEY3 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GOLGA6L3A6NEY3 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GOLGA6L3A6NEY3 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GOLGA6L3A6NEY3 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GOLGA6L3A6NEY3 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GOLGA6L3A6NEY3 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GOLGA6L3A6NEY3 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GOLGA6L3A6NEY3 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GOLGA6L3A6NEY3 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GOLGA6L3A6NEY3 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GOLGA6L3A6NEY3 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GOLGA6L3A6NEY3 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GOLGA6L3A6NEY3 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GOLGA6L3A6NEY3 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GOLGA6L3A6NEY3 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GOLGA6L3A6NEY3 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GOLGA6L3A6NEY3 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GOLGA6L3A6NEY3 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GOLGA6L3A6NEY3 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GOLGA6L3A6NEY3 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GOLGA6L3A6NEY3 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GOLGA6L3A6NEY3 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GOLGA6L3A6NEY3 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GOLGA6L3A6NEY3 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GOLGA6L3A6NEY3 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GOLGA6L3A6NEY3 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GOLGA6L3A6NEY3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GOLGA6L3A6NEY3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GOLGA6L3A6NEY3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GOLGA6L3A6NEY3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GOLGA6L3A6NEY3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GOLGA6L3A6NEY3 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GOLGA6L3A6NEY3 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GOLGA6L3A6NEY3 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GOLGA6L3A6NEY3 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GOLGA6L3A6NEY3 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GOLGA6L3A6NEY3 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GOLGA6L3A6NEY3 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GOLGA6L3A6NEY3 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GOLGA6L3A6NEY3 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms