Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI5

LINC00862, Putative transmembrane protein encoded by LINC00862, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00862A6NCI5 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms