Protein–RNA interactions for Protein: A5D8V6

VPS37C, Vacuolar protein sorting-associated protein 37C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37CA5D8V6 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms