Protein–RNA interactions for Protein: A5A3E0

POTEF, POTE ankyrin domain family member F, humanhuman

Predictions only

Length 1,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEFA5A3E0 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
POTEFA5A3E0 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
POTEFA5A3E0 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POTEFA5A3E0 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POTEFA5A3E0 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POTEFA5A3E0 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POTEFA5A3E0 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POTEFA5A3E0 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POTEFA5A3E0 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POTEFA5A3E0 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POTEFA5A3E0 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POTEFA5A3E0 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POTEFA5A3E0 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POTEFA5A3E0 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POTEFA5A3E0 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POTEFA5A3E0 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POTEFA5A3E0 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POTEFA5A3E0 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POTEFA5A3E0 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POTEFA5A3E0 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POTEFA5A3E0 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POTEFA5A3E0 DCD-201ENST00000293371 645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POTEFA5A3E0 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
POTEFA5A3E0 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
POTEFA5A3E0 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POTEFA5A3E0 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
POTEFA5A3E0 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POTEFA5A3E0 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POTEFA5A3E0 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POTEFA5A3E0 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POTEFA5A3E0 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POTEFA5A3E0 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POTEFA5A3E0 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POTEFA5A3E0 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POTEFA5A3E0 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
POTEFA5A3E0 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POTEFA5A3E0 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POTEFA5A3E0 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POTEFA5A3E0 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POTEFA5A3E0 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POTEFA5A3E0 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POTEFA5A3E0 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POTEFA5A3E0 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
POTEFA5A3E0 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POTEFA5A3E0 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
POTEFA5A3E0 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
POTEFA5A3E0 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
POTEFA5A3E0 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
POTEFA5A3E0 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
POTEFA5A3E0 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POTEFA5A3E0 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POTEFA5A3E0 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POTEFA5A3E0 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POTEFA5A3E0 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POTEFA5A3E0 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POTEFA5A3E0 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
POTEFA5A3E0 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POTEFA5A3E0 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
POTEFA5A3E0 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
POTEFA5A3E0 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
POTEFA5A3E0 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POTEFA5A3E0 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POTEFA5A3E0 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POTEFA5A3E0 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
POTEFA5A3E0 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POTEFA5A3E0 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POTEFA5A3E0 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
POTEFA5A3E0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POTEFA5A3E0 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POTEFA5A3E0 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POTEFA5A3E0 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POTEFA5A3E0 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POTEFA5A3E0 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POTEFA5A3E0 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POTEFA5A3E0 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POTEFA5A3E0 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POTEFA5A3E0 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POTEFA5A3E0 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POTEFA5A3E0 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POTEFA5A3E0 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POTEFA5A3E0 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POTEFA5A3E0 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POTEFA5A3E0 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
POTEFA5A3E0 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POTEFA5A3E0 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POTEFA5A3E0 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POTEFA5A3E0 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POTEFA5A3E0 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POTEFA5A3E0 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POTEFA5A3E0 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POTEFA5A3E0 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POTEFA5A3E0 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POTEFA5A3E0 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POTEFA5A3E0 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POTEFA5A3E0 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POTEFA5A3E0 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POTEFA5A3E0 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POTEFA5A3E0 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POTEFA5A3E0 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POTEFA5A3E0 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms