Protein–RNA interactions for Protein: A4D1F6

LRRD1, Leucine-rich repeat and death domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRD1A4D1F6 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRRD1A4D1F6 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LRRD1A4D1F6 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LRRD1A4D1F6 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LRRD1A4D1F6 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LRRD1A4D1F6 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LRRD1A4D1F6 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LRRD1A4D1F6 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LRRD1A4D1F6 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LRRD1A4D1F6 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LRRD1A4D1F6 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LRRD1A4D1F6 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRRD1A4D1F6 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRRD1A4D1F6 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRRD1A4D1F6 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRRD1A4D1F6 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRRD1A4D1F6 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRRD1A4D1F6 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRRD1A4D1F6 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRRD1A4D1F6 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRRD1A4D1F6 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRRD1A4D1F6 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRRD1A4D1F6 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRRD1A4D1F6 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRRD1A4D1F6 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRRD1A4D1F6 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRRD1A4D1F6 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRRD1A4D1F6 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRRD1A4D1F6 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRRD1A4D1F6 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRRD1A4D1F6 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRRD1A4D1F6 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRRD1A4D1F6 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRRD1A4D1F6 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRRD1A4D1F6 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRRD1A4D1F6 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRRD1A4D1F6 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRRD1A4D1F6 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRRD1A4D1F6 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRRD1A4D1F6 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRRD1A4D1F6 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRRD1A4D1F6 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRRD1A4D1F6 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRRD1A4D1F6 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRRD1A4D1F6 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRRD1A4D1F6 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRRD1A4D1F6 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRRD1A4D1F6 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRRD1A4D1F6 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRRD1A4D1F6 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRRD1A4D1F6 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRRD1A4D1F6 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRRD1A4D1F6 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms