Protein–RNA interactions for Protein: A1L4H1

SSC5D, Soluble scavenger receptor cysteine-rich domain-containing protein SSC5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSC5DA1L4H1 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SSC5DA1L4H1 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSC5DA1L4H1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSC5DA1L4H1 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSC5DA1L4H1 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSC5DA1L4H1 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSC5DA1L4H1 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSC5DA1L4H1 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSC5DA1L4H1 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSC5DA1L4H1 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSC5DA1L4H1 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSC5DA1L4H1 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSC5DA1L4H1 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSC5DA1L4H1 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SSC5DA1L4H1 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSC5DA1L4H1 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSC5DA1L4H1 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSC5DA1L4H1 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSC5DA1L4H1 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSC5DA1L4H1 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSC5DA1L4H1 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSC5DA1L4H1 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSC5DA1L4H1 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSC5DA1L4H1 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSC5DA1L4H1 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSC5DA1L4H1 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSC5DA1L4H1 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSC5DA1L4H1 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SSC5DA1L4H1 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSC5DA1L4H1 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSC5DA1L4H1 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSC5DA1L4H1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSC5DA1L4H1 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSC5DA1L4H1 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSC5DA1L4H1 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSC5DA1L4H1 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSC5DA1L4H1 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSC5DA1L4H1 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSC5DA1L4H1 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSC5DA1L4H1 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSC5DA1L4H1 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSC5DA1L4H1 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSC5DA1L4H1 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSC5DA1L4H1 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSC5DA1L4H1 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSC5DA1L4H1 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SSC5DA1L4H1 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSC5DA1L4H1 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSC5DA1L4H1 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSC5DA1L4H1 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSC5DA1L4H1 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSC5DA1L4H1 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSC5DA1L4H1 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSC5DA1L4H1 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SSC5DA1L4H1 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SSC5DA1L4H1 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSC5DA1L4H1 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSC5DA1L4H1 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSC5DA1L4H1 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSC5DA1L4H1 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSC5DA1L4H1 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSC5DA1L4H1 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSC5DA1L4H1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSC5DA1L4H1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSC5DA1L4H1 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSC5DA1L4H1 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSC5DA1L4H1 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSC5DA1L4H1 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SSC5DA1L4H1 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SSC5DA1L4H1 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
SSC5DA1L4H1 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SSC5DA1L4H1 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SSC5DA1L4H1 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
SSC5DA1L4H1 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SSC5DA1L4H1 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SSC5DA1L4H1 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
SSC5DA1L4H1 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SSC5DA1L4H1 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SSC5DA1L4H1 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SSC5DA1L4H1 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SSC5DA1L4H1 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSC5DA1L4H1 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSC5DA1L4H1 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSC5DA1L4H1 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSC5DA1L4H1 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSC5DA1L4H1 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSC5DA1L4H1 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSC5DA1L4H1 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSC5DA1L4H1 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SSC5DA1L4H1 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSC5DA1L4H1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSC5DA1L4H1 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSC5DA1L4H1 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSC5DA1L4H1 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSC5DA1L4H1 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSC5DA1L4H1 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSC5DA1L4H1 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSC5DA1L4H1 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SSC5DA1L4H1 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSC5DA1L4H1 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms