Protein–RNA interactions for Protein: A1A4Y4

IRGM, Immunity-related GTPase family M protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGMA1A4Y4 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms