Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYP9

KRTAP9-9, Keratin-associated protein 9-9, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-9Q9BYP9 MYH2-202ENST00000397183 6078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 SPATA13-206ENST00000424834 8603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 ANKRD13A-201ENST00000261739 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 AL139274.2-201ENST00000606274 4127 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 MSS51-201ENST00000299432 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 GFI1B-201ENST00000339463 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 RASGEF1B-207ENST00000509081 3016 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 PTPRT-207ENST00000373201 12660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 CDCA3-202ENST00000422785 2760 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 SPTAN1-223ENST00000630866 7498 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 SPECC1-204ENST00000395527 3363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 CDK19-203ENST00000413605 6007 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 SLC17A8-201ENST00000323346 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 ELMO1-203ENST00000396045 2524 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 SLC6A7-201ENST00000230671 3739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 PLEKHB2-202ENST00000403716 4349 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF569-201ENST00000316950 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 IL18BP-209ENST00000497194 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 L3MBTL1-203ENST00000373135 3218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF836-204ENST00000597252 3209 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 ESR2-208ENST00000554572 3588 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 ITGA7-213ENST00000555728 3930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 MLH1-222ENST00000539477 2366 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 CTNNA2-203ENST00000402739 3684 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 AC062029.1-202ENST00000606164 3651 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 TLR10-208ENST00000622002 3673 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 LCORL-207ENST00000635767 10430 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 NEDD1-201ENST00000266742 4046 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 AC006372.3-201ENST00000444158 4049 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF423-204ENST00000562520 4018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 CPM-201ENST00000338356 6636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF667-202ENST00000504904 4390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 CCDC73-203ENST00000531481 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 AOX1-202ENST00000374700 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 NEIL1-201ENST00000355059 3759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 CDHR4-202ENST00000412678 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 IBTK-209ENST00000510291 4109 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 TBC1D8B-201ENST00000276175 3538 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 EIF4E3-205ENST00000448225 6209 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 NAMPT-201ENST00000222553 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 C2orf71-201ENST00000331664 7044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 DHX35-203ENST00000373325 3287 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 LGALSL-202ENST00000409537 3298 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 LARP4-202ENST00000347328 3621 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 FAM171A1-201ENST00000378116 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 NUTM2A-201ENST00000381689 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 RASSF6-203ENST00000342081 4331 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 SLFNL1-202ENST00000359345 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 RHBDL3-201ENST00000269051 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 FYB1-201ENST00000351578 4750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 CSPG4P4Y-201ENST00000333235 3724 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 OSBP2-203ENST00000403222 3728 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 CSPG4P3Y-201ENST00000418188 3724 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR100HG-212ENST00000531381 3370 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 PDE2A-218ENST00000540345 3027 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 CDH1-212ENST00000611625 4878 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 AMACR-201ENST00000335606 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 GAGE2A-201ENST00000362097 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 RNA5SP370-201ENST00000362545 121 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 FCAR-206ENST00000391724 762 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR1231-201ENST00000408101 92 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 RAB1C-201ENST00000409159 606 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 TRBV10-2-201ENST00000426318 395 ntAPPRIS P1 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 CD302-202ENST00000429078 3803 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 HCG2040054-201ENST00000435331 434 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 AC019185.3-201ENST00000438805 323 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 AC245517.3-201ENST00000440562 250 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 AL356421.2-201ENST00000446733 197 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 snoU13.24-201ENST00000458998 104 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 RN7SL361P-201ENST00000470785 298 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 RPL7AP6-201ENST00000477943 801 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 DPH3P1-201ENST00000486648 249 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 RN7SL314P-201ENST00000490735 292 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 ANKRD55-205ENST00000513241 626 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 AC023632.4-201ENST00000517783 191 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 IGHVIII-51-1-201ENST00000519403 302 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 ATP6V1G1P2-201ENST00000522436 346 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 RPL10P9-201ENST00000522551 645 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 AL590560.1-203ENST00000544342 408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 TUBB4BP1-201ENST00000545422 178 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 AC009997.1-201ENST00000557862 129 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 AC092123.1-202ENST00000565310 405 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR4490-201ENST00000582647 84 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 BOD1P1-201ENST00000584421 436 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 156.2 ms