Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 RN7SKP60-201ENST00000516985 239 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 AC009812.2-201ENST00000517657 457 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 IGKV1D-22-201ENST00000518953 324 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 AC008250.1-201ENST00000539874 522 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 CLMN-206ENST00000556441 452 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 AC008109.1-201ENST00000583163 826 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 FKBP1AP1-201ENST00000594588 318 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 AC091193.1-201ENST00000604640 448 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 AL136131.3-201ENST00000607600 188 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 AL132640.3-201ENST00000630473 177 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 SOX5-216ENST00000546136 6975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 DMD-222ENST00000474231 5209 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 AC074029.4-201ENST00000624796 1859 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 FAT4-202ENST00000394329 16123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 CEP85L-201ENST00000360290 1736 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 CCDC186-203ENST00000369287 7245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 UQCC1-208ENST00000397554 3638 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 EEF1A1P36-201ENST00000427807 1351 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 AP002370.1-201ENST00000528055 1602 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 AL136317.2-201ENST00000619851 2254 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 GRIA3-207ENST00000620443 4943 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 CARF-208ENST00000428585 2513 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 AC011504.1-201ENST00000623331 4103 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 ESRRG-204ENST00000361525 5363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 UGT8-202ENST00000394511 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 AL121886.1-201ENST00000358609 435 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 RN7SKP103-201ENST00000363848 320 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 TRAV19-201ENST00000390447 467 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 AL445928.1-201ENST00000435545 222 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 GAPDHP23-201ENST00000444823 993 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 AC017101.1-201ENST00000453665 571 ntTSL 4 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 TPPP2-202ENST00000460647 568 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 AC108161.1-201ENST00000461060 402 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 AC103987.1-201ENST00000473394 348 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 LINC01206-205ENST00000490001 949 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 AC091180.4-201ENST00000511322 245 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 AC107391.1-201ENST00000514966 412 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 LINC00871-201ENST00000555246 408 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 THSD4-AS1-201ENST00000561571 554 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 MIR4527HG-203ENST00000600127 704 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 AC067931.1-201ENST00000624190 671 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 LDHA-225ENST00000625635 141 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 DOCK11P1-201ENST00000553480 5932 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 MAGI2-235ENST00000637282 3174 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 FBXO3-208ENST00000530401 7410 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 AC092447.5-201ENST00000429367 2741 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 TMED3-202ENST00000424155 16555 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 CALN1-204ENST00000405452 8571 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 AL499616.1-201ENST00000415437 2633 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 GPN1-205ENST00000458167 1618 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 TMPRSS15-201ENST00000284885 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 CLUL1-213ENST00000620089 1947 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 GPAM-202ENST00000369425 5664 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 PDE1A-204ENST00000410103 2000 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 SRBD1-201ENST00000263736 3681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 EIF2AP4-201ENST00000424793 1781 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 PPEF1-202ENST00000361511 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 OR7C1-204ENST00000642000 11290 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 PABPC1P6-201ENST00000445594 1829 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 MECOM-202ENST00000433243 3508 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 HIST1H2BD-201ENST00000289316 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 MIR223-201ENST00000385204 110 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 AC092111.3-201ENST00000402465 496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 CCDC13-AS1-202ENST00000446950 554 ntTSL 4 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 RANP2-201ENST00000456833 229 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 HMGB3P30-201ENST00000457863 606 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 RPL37P6-202ENST00000464216 403 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 LINC01210-201ENST00000465283 625 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 AP000926.1-201ENST00000479573 241 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 AC004889.1-208ENST00000489077 423 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 PGAM1P13-201ENST00000507497 754 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 SNORA43.3-201ENST00000517240 103 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
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