Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 ESRRG-204ENST00000361525 5363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 ASB5-201ENST00000296525 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 ADAM5-202ENST00000399789 1942 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 ADGRL3-216ENST00000514157 4789 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 PRG4-202ENST00000367483 4921 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 GAPT-202ENST00000396776 3016 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 CACNB4-221ENST00000636130 7748 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 NOSTRIN-207ENST00000445023 1569 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 RPL7P26-201ENST00000333817 754 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 PLAC1-201ENST00000359237 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 OR10R3P-201ENST00000361688 942 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 RN7SKP78-201ENST00000364711 318 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 RNA5SP211-201ENST00000365516 117 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 C1orf100-202ENST00000366537 483 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 TRGV5-201ENST00000390344 552 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 AL121834.1-202ENST00000404494 277 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 NUTM2A-AS1-203ENST00000413961 501 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 HMGB3P24-201ENST00000433260 622 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 AC004691.1-201ENST00000440376 547 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 AC097359.1-201ENST00000447946 463 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 LINC01496-201ENST00000448761 460 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 AC107072.1-201ENST00000449007 110 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 AC118758.1-202ENST00000454719 225 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 SNORD125-201ENST00000459538 96 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 RPL21P8-201ENST00000465083 535 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 LINC02114-201ENST00000503757 801 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 Y_RNA.710-201ENST00000516975 110 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 RN7SKP99-201ENST00000517028 307 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 IGLV3-24-201ENST00000517477 197 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 AC011853.1-201ENST00000518911 454 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 AL160262.1-201ENST00000522264 254 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 PRR4-206ENST00000540107 388 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 AC117373.1-201ENST00000544036 392 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 AC008083.3-201ENST00000547777 329 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 AL049839.1-201ENST00000556151 657 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 AC022196.1-202ENST00000559570 462 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 NUFIP2-202ENST00000579665 559 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 RN7SL230P-201ENST00000580835 303 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 MIR4310-201ENST00000582950 57 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 AC026898.1-201ENST00000586404 571 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 AC022154.1-203ENST00000594850 493 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 NANOGP3-201ENST00000605855 286 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 AL139124.1-201ENST00000609123 421 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 Metazoa_SRP.199-201ENST00000615501 281 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 SAMMSON-227ENST00000642114 1199 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 ELAVL4-203ENST00000371821 3349 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 ZFYVE16-201ENST00000338008 6773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 LRRC39-203ENST00000370138 1466 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 ETV1-203ENST00000403527 3363 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 PATJ-213ENST00000613764 4172 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 ZNF347-201ENST00000334197 7960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 NLRP11-201ENST00000589093 3417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 RIOK3P1-201ENST00000418778 1528 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 MLIP-213ENST00000514921 5743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 CCR2-201ENST00000292301 2671 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 FAM197Y7-202ENST00000433321 2325 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 AP1G1-207ENST00000564155 2723 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 CCSER1-201ENST00000432775 3927 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 ZNF845-201ENST00000458035 4311 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.11□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 CNTN5-201ENST00000279463 5925 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 TMEM71-201ENST00000356838 1993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 SGO1-AS1-203ENST00000455626 2041 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 KLF12-201ENST00000377669 10637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 AC092681.1-201ENST00000297369 291 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 RNU1-5P-201ENST00000362684 144 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 RNU105B-201ENST00000364478 208 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
ODF1Q14990 DEFB110-201ENST00000371148 384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 186.5 ms