Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 AC009302.1-201ENST00000417147 390 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 MTCO1P3-201ENST00000429327 192 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 PPEF1-AS1-201ENST00000430641 430 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 RPL39L-202ENST00000433055 749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 AL831737.1-201ENST00000441288 271 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 AC009950.1-206ENST00000445199 517 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 AL133260.2-201ENST00000445833 396 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 AL080313.2-201ENST00000456440 489 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 AL356270.1-201ENST00000456587 522 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 LINC02496-201ENST00000509559 584 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 ERAP2-205ENST00000510309 1275 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 RNU6-885P-201ENST00000516607 104 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 RN7SKP116-201ENST00000516902 319 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 AC067817.1-201ENST00000518535 356 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 PSMA2P1-201ENST00000526365 646 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 AC098617.1-216ENST00000602099 708 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 AC016877.3-201ENST00000606778 504 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 AC092954.1-201ENST00000609121 445 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 AP005137.2-201ENST00000609238 400 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 AL359535.1-201ENST00000612100 1087 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 KIF15-203ENST00000425755 3460 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 MBNL1-218ENST00000485910 4257 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 PCAT4-201ENST00000504263 2091 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 CRISP3-201ENST00000263045 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 AC011978.2-201ENST00000569835 2054 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 RAP2C-AS1-202ENST00000441399 3473 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 RNU6-549P-201ENST00000384433 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 RPL30P2-201ENST00000414021 291 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 AL589946.1-201ENST00000421465 420 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 AL353678.1-201ENST00000422735 741 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 RPL12P46-201ENST00000436610 195 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 AC010976.1-211ENST00000454503 644 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 AC121764.2-201ENST00000469806 587 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 AC010683.1-201ENST00000473673 378 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 AC108729.1-201ENST00000487812 947 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 AC021146.5-201ENST00000503544 545 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 GYPA-204ENST00000504786 357 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 AC093725.2-201ENST00000507808 356 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 AP003170.4-201ENST00000543486 586 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 AC009803.2-201ENST00000550378 665 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 OR4U1P-201ENST00000554958 912 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 AC090695.1-201ENST00000561269 1222 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 AC087463.3-201ENST00000570105 415 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 MIR4644-201ENST00000579929 84 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 MIR4512-201ENST00000583257 77 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 LINC01539-206ENST00000593282 678 ntTSL 4 BASIC2.92□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 AL035411.2-201ENST00000604022 421 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 AC009220.3-201ENST00000604318 586 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 AC007349.4-201ENST00000608114 532 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 AL157817.1-201ENST00000614264 790 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 KLRC2-206ENST00000619500 883 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 SATB1-AS1-266ENST00000630271 813 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 ATF2-221ENST00000538946 1325 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 BLM-208ENST00000560509 3966 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 RNF111-206ENST00000559209 5278 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 CYSLTR2-201ENST00000282018 4672 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 TPTE2-202ENST00000382978 1677 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 AL592437.2-201ENST00000421655 2434 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 FOXP2-224ENST00000635534 4290 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 AC073130.1-201ENST00000457033 1958 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 HTN1-201ENST00000246896 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 CAPZA3-201ENST00000317658 1087 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 UTS2-202ENST00000361696 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 TUBD1-204ENST00000376094 1154 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 IGLV5-37-201ENST00000390300 374 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 SSR1P2-201ENST00000415208 787 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 HIGD1AP15-201ENST00000416198 280 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 AL049765.1-201ENST00000416237 573 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 MTCO2P21-201ENST00000419780 677 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 GRK5-IT1-201ENST00000421206 400 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 LINC01598-201ENST00000432067 460 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 AC072062.1-204ENST00000437897 1132 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 AC093155.1-201ENST00000440164 826 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 MTCYBP42-201ENST00000444653 1130 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 AL021393.1-201ENST00000456740 539 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 NF1P3-201ENST00000457709 450 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 PNPLA4P1-201ENST00000458328 305 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 snoU13.7-201ENST00000459220 104 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 RN7SL594P-201ENST00000470590 287 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 RPS4XP13-201ENST00000483219 789 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 LINC02032-201ENST00000490465 391 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 NIPA2P2-201ENST00000496376 1083 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 AC084024.2-201ENST00000503480 791 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 APOOP4-201ENST00000513530 597 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 AC104012.1-201ENST00000517848 719 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 AC025524.2-207ENST00000520097 506 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 OR4R3P-201ENST00000525084 838 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 AC125611.1-201ENST00000549563 229 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GTF3C1Q12789 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.1 ms