Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPB7

AP5B1, AP-5 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP5B1Q2VPB7 MIR4277-201ENST00000578298 84 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
AP5B1Q2VPB7 AL157938.2-204ENST00000589667 826 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
AP5B1Q2VPB7 AL669831.4-202ENST00000590817 238 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
AP5B1Q2VPB7 RSL24D1P11-201ENST00000591045 491 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
AP5B1Q2VPB7 AC012065.4-201ENST00000602445 679 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
AP5B1Q2VPB7 AC008745.1-201ENST00000604064 271 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
AP5B1Q2VPB7 AC103710.4-201ENST00000609301 899 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
AP5B1Q2VPB7 SLC38A2-214ENST00000612232 1221 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
AP5B1Q2VPB7 AC004825.2-201ENST00000616634 455 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
AP5B1Q2VPB7 MALAT1-210ENST00000617489 318 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
AP5B1Q2VPB7 AC138393.3-201ENST00000618397 573 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
AP5B1Q2VPB7 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
AP5B1Q2VPB7 SCEL-201ENST00000349847 2386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
AP5B1Q2VPB7 SYNE2-204ENST00000358025 21842 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
AP5B1Q2VPB7 FGD4-213ENST00000546442 3503 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
AP5B1Q2VPB7 MAP3K21-201ENST00000366622 4005 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
AP5B1Q2VPB7 KATNA1-202ENST00000335647 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
AP5B1Q2VPB7 PTP4A1-205ENST00000626021 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
AP5B1Q2VPB7 HERC4-204ENST00000395198 4445 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
AP5B1Q2VPB7 SLC38A9-223ENST00000515629 2673 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
AP5B1Q2VPB7 SGO1-205ENST00000419233 1582 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
AP5B1Q2VPB7 AC110760.2-201ENST00000508031 2546 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
AP5B1Q2VPB7 AL136964.1-201ENST00000622038 2990 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
AP5B1Q2VPB7 NR3C1-202ENST00000343796 7286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
AP5B1Q2VPB7 Z82217.1-201ENST00000625157 8149 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
AP5B1Q2VPB7 C1orf112-203ENST00000413811 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
AP5B1Q2VPB7 IFI16-208ENST00000448393 2245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
AP5B1Q2VPB7 UBE4A-201ENST00000252108 6103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
AP5B1Q2VPB7 ASAH2-201ENST00000329428 2184 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
AP5B1Q2VPB7 MT-ND3-201ENST00000361227 346 ntAPPRIS P1 BASIC4.05□□□□□ -1.76
AP5B1Q2VPB7 RNU1-14P-201ENST00000362759 152 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
AP5B1Q2VPB7 RNA5SP509-201ENST00000364577 119 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
AP5B1Q2VPB7 SNORA37-201ENST00000384504 129 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
AP5B1Q2VPB7 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
AP5B1Q2VPB7 AC136624.1-201ENST00000400791 413 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
AP5B1Q2VPB7 AL355379.1-201ENST00000405542 640 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
AP5B1Q2VPB7 RNA5SP36-201ENST00000410197 133 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
AP5B1Q2VPB7 RN7SKP235-201ENST00000410662 305 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
AP5B1Q2VPB7 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
AP5B1Q2VPB7 RN7SKP142-201ENST00000411236 328 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
AP5B1Q2VPB7 RNA5SP39-201ENST00000411245 120 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
AP5B1Q2VPB7 AC092155.1-202ENST00000416111 932 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
AP5B1Q2VPB7 AL445669.1-201ENST00000426743 755 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
AP5B1Q2VPB7 AC006548.1-201ENST00000427470 102 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
AP5B1Q2VPB7 AC109583.1-201ENST00000432156 268 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
AP5B1Q2VPB7 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
AP5B1Q2VPB7 CBX1P1-201ENST00000440184 427 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
AP5B1Q2VPB7 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
AP5B1Q2VPB7 CDC27P1-201ENST00000445384 715 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
AP5B1Q2VPB7 AP000844.1-201ENST00000446631 577 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
AP5B1Q2VPB7 AP000542.1-201ENST00000448473 371 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
AP5B1Q2VPB7 AL451050.1-201ENST00000450126 415 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
AP5B1Q2VPB7 AL645939.1-201ENST00000453429 797 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
AP5B1Q2VPB7 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
AP5B1Q2VPB7 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
AP5B1Q2VPB7 RN7SL303P-201ENST00000469773 251 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
AP5B1Q2VPB7 AP000926.1-201ENST00000479573 241 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
AP5B1Q2VPB7 RPS29P19-201ENST00000479709 171 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
AP5B1Q2VPB7 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
AP5B1Q2VPB7 AC068724.1-201ENST00000487100 792 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
AP5B1Q2VPB7 HMGB1P36-201ENST00000487709 576 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
AP5B1Q2VPB7 AC004069.2-201ENST00000505438 1114 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
AP5B1Q2VPB7 AC113404.3-201ENST00000506621 555 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
AP5B1Q2VPB7 KCTD9P2-201ENST00000512203 1013 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
AP5B1Q2VPB7 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
AP5B1Q2VPB7 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
AP5B1Q2VPB7 AC008780.1-201ENST00000513392 409 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
AP5B1Q2VPB7 SNHG1-208ENST00000538266 347 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
AP5B1Q2VPB7 AC018410.2-201ENST00000540410 610 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
AP5B1Q2VPB7 AC013437.1-201ENST00000549878 414 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
AP5B1Q2VPB7 TVP23BP1-201ENST00000557500 617 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
AP5B1Q2VPB7 MIR4700-201ENST00000578311 74 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
AP5B1Q2VPB7 MIR4307-201ENST00000582802 84 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
AP5B1Q2VPB7 MIR7515HG-213ENST00000585872 758 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
AP5B1Q2VPB7 AC010649.1-203ENST00000592230 454 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
AP5B1Q2VPB7 AC025946.2-201ENST00000603398 234 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
AP5B1Q2VPB7 PRELID3BP8-201ENST00000604148 295 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
AP5B1Q2VPB7 CT45A9-201ENST00000604569 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
AP5B1Q2VPB7 AC068276.1-201ENST00000605793 379 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
AP5B1Q2VPB7 CT45A8-201ENST00000611438 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
AP5B1Q2VPB7 CT45A10-202ENST00000617981 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
AP5B1Q2VPB7 CT45A7-202ENST00000620885 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
AP5B1Q2VPB7 AC009878.1-201ENST00000621819 340 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
AP5B1Q2VPB7 ATXN3L-202ENST00000622204 837 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
AP5B1Q2VPB7 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
AP5B1Q2VPB7 GOLT1B-210ENST00000631252 223 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
AP5B1Q2VPB7 SEC23A-202ENST00000537403 4215 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
AP5B1Q2VPB7 CCNYL2-202ENST00000637719 3311 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
AP5B1Q2VPB7 DNAH12-202ENST00000351747 9542 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
AP5B1Q2VPB7 AL133412.1-201ENST00000380194 2992 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
AP5B1Q2VPB7 AC092650.1-201ENST00000447571 1808 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
AP5B1Q2VPB7 LRRC9-202ENST00000445360 4717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
AP5B1Q2VPB7 C6orf10-207ENST00000533191 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
AP5B1Q2VPB7 MYCBP2-211ENST00000544440 14664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
AP5B1Q2VPB7 P2RY12-201ENST00000302632 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
AP5B1Q2VPB7 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
AP5B1Q2VPB7 NPVF-201ENST00000222674 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
AP5B1Q2VPB7 OR11H4-201ENST00000315409 1082 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
AP5B1Q2VPB7 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
AP5B1Q2VPB7 SYF2-202ENST00000354361 926 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
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