Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 RPL31P3-201ENST00000458430 332 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 GUCA1C-203ENST00000471108 633 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 BZW1P2-201ENST00000473537 826 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 SYPL1P1-201ENST00000473622 768 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 AC131211.1-201ENST00000497285 483 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 UBE2CP3-201ENST00000502715 450 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 LINC02213-202ENST00000506021 774 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 RNU6-232P-201ENST00000517144 64 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 AC018861.2-201ENST00000518078 513 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 AL355922.1-201ENST00000555624 337 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 AP001180.2-201ENST00000579413 422 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 AC090506.1-201ENST00000583089 572 ntTSL 4 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 AP005264.4-201ENST00000592203 422 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 AL031985.2-201ENST00000600955 480 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 AC010738.1-201ENST00000604970 987 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 AC006270.3-201ENST00000605967 1036 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 RN7SKP299-201ENST00000606679 301 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 CGA-204ENST00000627148 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 EVI2A-202ENST00000461237 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 LINC00648-202ENST00000555985 2885 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 UBE3AP2-201ENST00000429033 2259 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 RTN4-209ENST00000405240 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 P2RY13-201ENST00000325602 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 TMCO5A-203ENST00000558158 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 DEFB129-201ENST00000246105 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 RNA5SP97-201ENST00000365006 84 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 SPANXN4-201ENST00000370504 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 AC007066.1-201ENST00000392902 381 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 SNORA3.3-201ENST00000408712 125 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 RNU6-648P-201ENST00000410190 107 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 RNU6-757P-201ENST00000410334 100 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 RNU6-77P-201ENST00000410554 91 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 AC127526.1-201ENST00000417526 366 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 RPL39L-202ENST00000433055 749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 MTCO3P5-201ENST00000433620 714 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 KCTD9P3-201ENST00000434597 1169 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 AC016644.1-201ENST00000438553 434 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 ATP2B2-IT1-201ENST00000440152 472 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 CSN1S2AP-201ENST00000451783 779 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 AL355997.1-202ENST00000454361 610 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 RPL36AP13-201ENST00000457490 317 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 DYNLL1P6-201ENST00000503440 264 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
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CCDC6Q16204 AC024022.1-202ENST00000508911 394 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 FTH1P9-201ENST00000513251 355 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 XIRP2-AS1-201ENST00000525330 776 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 DEFB130C-202ENST00000530001 230 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 AC022240.1-201ENST00000532065 684 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 AC073530.1-201ENST00000535917 775 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 ERP27-202ENST00000540097 993 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 RAB3IP-214ENST00000550847 670 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 AL135746.1-201ENST00000554205 547 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 AL133370.1-201ENST00000554679 537 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 SRP54-AS1-203ENST00000556355 603 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 GTF2IP8-201ENST00000560687 584 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 AC087463.4-202ENST00000566676 579 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 MIR3915-201ENST00000578518 97 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 SATB1-AS1-222ENST00000600177 751 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 AL390816.3-201ENST00000604527 1066 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 AC016877.3-201ENST00000606778 504 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 VN1R7P-201ENST00000619242 903 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 CR392039.4-201ENST00000624968 501 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 MIR1322-201ENST00000638013 71 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 ZNF439-201ENST00000304030 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 CEP170P1-201ENST00000502249 4587 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 AC021086.1-201ENST00000499025 1569 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 NOL8P1-201ENST00000508336 3529 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 ZNF705A-201ENST00000359286 3455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 MFSD8-236ENST00000641509 4050 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 RAB3C-201ENST00000282878 8896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 LIPI-201ENST00000344577 1652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 RNU4-92P-201ENST00000363783 136 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 C9orf92-201ENST00000380683 359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 AL121978.1-201ENST00000402778 359 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 HSPE1P8-201ENST00000406997 288 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 RNU6-575P-201ENST00000411326 105 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 AL049737.1-201ENST00000413920 1403 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 TRAPPC2P10-201ENST00000415662 323 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 AC010890.1-202ENST00000432414 535 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 AC068533.3-201ENST00000435524 404 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 AL451129.1-201ENST00000437471 285 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 AC092013.1-201ENST00000438795 332 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 AL365258.1-201ENST00000440885 247 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
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