Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 MTCO1P43-201ENST00000431831 488 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 OR9N1P-202ENST00000494289 481 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 AC109349.1-201ENST00000503299 758 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 AC097512.1-203ENST00000506425 957 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 AL049870.4-201ENST00000555741 486 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 YWHAZP1-201ENST00000556286 722 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 AC090912.2-203ENST00000581177 477 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 AC103810.2-203ENST00000584959 631 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 AC091132.5-204ENST00000586348 630 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 AL391262.2-201ENST00000622466 494 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 AC107398.4-201ENST00000635489 765 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 IGLV5-37-201ENST00000390300 374 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 AC024084.1-201ENST00000440744 455 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 ZNF736P6Y-201ENST00000447526 1213 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 AL138737.1-201ENST00000456896 1252 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 AC121161.1-201ENST00000510606 652 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 MTCO3P27-201ENST00000514397 196 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 AC023158.1-201ENST00000561632 1025 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 MSMB-201ENST00000581478 386 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 AC133794.1-201ENST00000602731 914 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 OR4A15-202ENST00000641526 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 WDR72-201ENST00000360509 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 LIPI-204ENST00000614229 1439 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 FAM114A2-210ENST00000520313 1394 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 LINC01021-204ENST00000512067 1610 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 ASB17-201ENST00000284142 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 CFHR4-203ENST00000367418 1066 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 RNU4-74P-201ENST00000411280 161 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 AL606495.1-201ENST00000422100 813 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 BACH1-IT3-201ENST00000429843 406 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 ZNF736P1Y-201ENST00000440402 1276 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 RPL21P47-201ENST00000483696 477 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 AP001646.3-201ENST00000526305 446 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 MS4A1-205ENST00000528313 928 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 OSBPL9P3-201ENST00000534523 595 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 PDZD9-203ENST00000537222 1068 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 AC108721.1-201ENST00000547088 348 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 MIR4644-201ENST00000579929 84 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 AP000919.1-202ENST00000581139 1264 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 AC068620.3-201ENST00000602749 560 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 AC092953.2-201ENST00000608000 699 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 AC004825.2-201ENST00000616634 455 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 CC2D2B-209ENST00000618242 980 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 KIF15-203ENST00000425755 3460 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 RTTN-201ENST00000255674 6960 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 AL592494.2-201ENST00000425455 1548 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 SNORD115-48-201ENST00000364764 76 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 AL590385.1-201ENST00000419446 462 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 ARL2BPP3-201ENST00000421226 480 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 AC003659.1-201ENST00000424251 465 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 MTCO3P21-201ENST00000430791 643 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 AL139294.1-201ENST00000435739 512 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 AL353898.1-201ENST00000444055 238 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 CLIC4P1-201ENST00000453177 535 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 C1orf185-202ENST00000467127 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 AC107918.3-201ENST00000533272 382 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 LINC02448-201ENST00000548613 583 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 CD24P2-201ENST00000565486 219 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 AL133445.2-201ENST00000611191 527 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 XIRP2-204ENST00000409273 12269 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 DEFB133-201ENST00000398721 186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 RNU2-17P-201ENST00000410290 190 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 UBE2V1P9-201ENST00000414760 368 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 MRPL50P2-201ENST00000416821 482 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 UBE2D3P3-201ENST00000426992 425 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 RPS6P12-201ENST00000432491 726 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 TRAPPC13P1-201ENST00000435991 1062 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 AL354936.1-201ENST00000441521 649 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 AC016903.1-201ENST00000444017 588 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 AC003991.1-202ENST00000447058 777 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 MTCO2P9-201ENST00000503214 694 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 LINC02270-201ENST00000505386 610 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 AC010376.1-201ENST00000522101 334 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 AC105031.3-201ENST00000524359 616 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 OR5G4P-201ENST00000525251 760 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.9 ms