Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 PPIAP30-201ENST00000415473 519 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 RPL23AP67-201ENST00000465341 474 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 RN7SL688P-201ENST00000471754 275 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 AC078817.1-201ENST00000492623 435 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 AC114324.2-202ENST00000503812 134 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 ASB8-207ENST00000536953 923 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 HNF1A-AS1-203ENST00000537361 659 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 U1.40-201ENST00000610976 164 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 U1.27-201ENST00000615842 164 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 ERBIN-205ENST00000416865 2351 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 FASLG-202ENST00000367721 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 ARCN1-202ENST00000359415 4038 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 CTNND1-202ENST00000361332 6295 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 AC026316.3-201ENST00000497988 3097 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 KCNH7-202ENST00000332142 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 FBXL13-207ENST00000455112 2274 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 OR5M2P-202ENST00000641241 4242 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 SEC24A-202ENST00000398844 6299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 PRIM2-207ENST00000615550 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 KLHL13-206ENST00000469946 2353 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 NLRP5-201ENST00000390649 3888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 NUMB-203ENST00000359560 3309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 CEACAM1-207ENST00000403444 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 AL391666.1-201ENST00000442570 2764 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 AL450124.1-201ENST00000376401 353 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 AL139327.1-201ENST00000382988 348 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 KRT18P52-201ENST00000404956 846 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 AC108075.1-201ENST00000424692 529 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 AL391361.2-203ENST00000443380 413 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 AC114488.2-222ENST00000445166 362 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 RN7SL516P-201ENST00000496127 297 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 AC026461.2-201ENST00000568608 244 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 MIR6886-201ENST00000619864 61 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
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HOXD11P31277 STC1-201ENST00000290271 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 TXNRD1-204ENST00000429002 3855 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 SLC11A2-202ENST00000262052 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 CYFIP2-221ENST00000618329 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 CEP250-202ENST00000397527 15703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 TRIM55-204ENST00000353317 2624 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
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HOXD11P31277 IQCH-AS1-203ENST00000559298 5753 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 CXCL9-201ENST00000264888 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 LINC01360-203ENST00000440762 3871 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
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HOXD11P31277 AP003972.1-201ENST00000625192 5446 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 ZKSCAN5-203ENST00000451158 3111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 ZNF3-203ENST00000303915 3473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 LEO1-201ENST00000299601 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
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HOXD11P31277 FRMD4B-210ENST00000478263 3761 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
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HOXD11P31277 VWA3A-202ENST00000389398 4600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 MAPK10-290ENST00000641237 2826 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 ZNF438-202ENST00000361310 3144 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 PUS7L-207ENST00000551923 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 KIAA2012-204ENST00000498697 3772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
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HOXD11P31277 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 AP002088.1-201ENST00000382740 395 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 SNORA70G-201ENST00000383923 142 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 OR2H1-204ENST00000396792 1294 ntAPPRIS P1 BASIC7.91□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 MIR1266-201ENST00000408125 84 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 RN7SKP229-201ENST00000410465 302 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 RPL12P4-201ENST00000432629 497 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 AL160271.1-201ENST00000444708 829 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 LINC01422-203ENST00000447149 509 ntTSL 4 BASIC7.91□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 OR7E62P-201ENST00000456741 477 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 AC113208.1-201ENST00000497944 318 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 ENPP7P11-201ENST00000505915 627 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 NDUFA3P2-201ENST00000531434 232 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 AL136139.1-201ENST00000605568 222 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 MIR6823-201ENST00000622118 61 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 BCLAF3-203ENST00000379687 6528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 SLC13A3-202ENST00000290317 3994 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 PRLR-216ENST00000542609 1764 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 FBXO7-202ENST00000397426 1888 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 AC116535.1-201ENST00000499765 2335 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 ZNF451-204ENST00000370708 9478 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 DOCK4-216ENST00000494651 3282 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 RMST-209ENST00000639542 3269 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 SLC25A24-202ENST00000370041 3404 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
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