Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 TRGV11-201ENST00000390340 463 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
PTPRBP23467 CYCSP45-201ENST00000402289 315 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTPRBP23467 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTPRBP23467 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTPRBP23467 FAM103A2P-201ENST00000444122 354 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTPRBP23467 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTPRBP23467 TXNP6-201ENST00000510190 310 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTPRBP23467 AC117525.1-201ENST00000515228 503 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTPRBP23467 RN7SKP60-201ENST00000516985 239 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTPRBP23467 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
PTPRBP23467 AC025857.1-201ENST00000525252 377 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTPRBP23467 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
PTPRBP23467 AC022884.3-201ENST00000579571 248 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTPRBP23467 AC011468.4-201ENST00000603942 409 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTPRBP23467 CRISP3-201ENST00000263045 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PTPRBP23467 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PTPRBP23467 RNF6P1-201ENST00000444889 1784 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTPRBP23467 ZNF33CP-201ENST00000432492 2030 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPRBP23467 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPRBP23467 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPRBP23467 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPRBP23467 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPRBP23467 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPRBP23467 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPRBP23467 AC092598.1-201ENST00000431708 797 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
PTPRBP23467 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
PTPRBP23467 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPRBP23467 TRAV31-201ENST00000502780 342 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPRBP23467 AC019227.1-201ENST00000526902 510 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPRBP23467 AP001646.1-201ENST00000527936 915 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPRBP23467 AC025260.1-201ENST00000548858 430 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPRBP23467 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPRBP23467 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
PTPRBP23467 AC090618.1-201ENST00000571972 585 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
PTPRBP23467 AC080078.1-201ENST00000603643 410 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
PTPRBP23467 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPRBP23467 AC105429.2-201ENST00000610567 517 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPRBP23467 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPRBP23467 ASAH1-263ENST00000637872 886 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
PTPRBP23467 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
PTPRBP23467 RNVU1-3-201ENST00000364313 161 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPRBP23467 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPRBP23467 AC015971.1-202ENST00000439077 514 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
PTPRBP23467 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
PTPRBP23467 C1DP3-201ENST00000455013 423 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPRBP23467 LINC01075-201ENST00000455977 370 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
PTPRBP23467 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPRBP23467 AC068633.1-201ENST00000482142 787 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
PTPRBP23467 MTCO1P30-201ENST00000515244 580 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPRBP23467 OR5D17P-201ENST00000531492 978 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPRBP23467 FBXO3-210ENST00000532057 918 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
PTPRBP23467 YWHAZP1-201ENST00000556286 722 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPRBP23467 AC091563.1-202ENST00000574086 522 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
PTPRBP23467 TFG-209ENST00000615993 1244 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PTPRBP23467 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
PTPRBP23467 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPRBP23467 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
PTPRBP23467 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
PTPRBP23467 MFF-206ENST00000392059 1710 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
PTPRBP23467 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
PTPRBP23467 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
PTPRBP23467 OR8H1-201ENST00000313022 1038 ntAPPRIS P2 BASIC2.53□□□□□ -2
PTPRBP23467 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPRBP23467 GSTA12P-201ENST00000402398 508 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPRBP23467 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPRBP23467 AL121578.1-201ENST00000428051 892 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPRBP23467 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPRBP23467 AC023590.1-204ENST00000434023 431 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
PTPRBP23467 WASF1P1-201ENST00000447560 1131 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPRBP23467 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPRBP23467 RPL23AP15-201ENST00000450202 459 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPRBP23467 ST13P14-201ENST00000474095 734 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPRBP23467 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPRBP23467 RNU6-491P-201ENST00000516099 110 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPRBP23467 RN7SKP244-201ENST00000516513 307 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPRBP23467 AC025434.1-201ENST00000520705 460 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
PTPRBP23467 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
PTPRBP23467 PTP4A1P6-201ENST00000531034 478 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPRBP23467 ZEB2-AS1-204ENST00000595109 855 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
PTPRBP23467 AC007621.1-201ENST00000604544 437 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPRBP23467 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPRBP23467 OR6C3-203ENST00000641740 1093 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
PTPRBP23467 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPRBP23467 LINC01085-201ENST00000502759 1984 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
PTPRBP23467 DCAF13P3-201ENST00000561147 1334 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPRBP23467 RNF38-201ENST00000259605 5012 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
PTPRBP23467 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
PTPRBP23467 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2.01
PTPRBP23467 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
PTPRBP23467 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.53□□□□□ -2.01
PTPRBP23467 NME5-201ENST00000265191 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRBP23467 AC245054.2-201ENST00000415639 319 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRBP23467 AL357315.1-201ENST00000422930 254 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRBP23467 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRBP23467 RNU4-60P-201ENST00000517239 135 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRBP23467 AC006557.3-201ENST00000592926 517 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRBP23467 PCNAP1-202ENST00000595299 752 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRBP23467 C1orf185-204ENST00000612209 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRBP23467 METTL8-218ENST00000638989 876 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRBP23467 METTL8-219ENST00000640734 726 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.6 ms