Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E7

PCDH10, Protocadherin-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH10Q9P2E7 LCE6A-201ENST00000431011 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PCDH10Q9P2E7 AC010326.1-201ENST00000462726 602 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PCDH10Q9P2E7 AC034236.1-201ENST00000469891 373 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PCDH10Q9P2E7 AC027309.2-201ENST00000520566 192 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PCDH10Q9P2E7 AC009643.1-201ENST00000532030 391 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PCDH10Q9P2E7 AC104002.2-201ENST00000553919 318 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PCDH10Q9P2E7 AL390816.1-201ENST00000553990 322 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PCDH10Q9P2E7 AC090771.2-201ENST00000588794 571 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PCDH10Q9P2E7 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PCDH10Q9P2E7 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PCDH10Q9P2E7 LINC00310-206ENST00000609947 892 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PCDH10Q9P2E7 MDM4-215ENST00000614459 9782 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PCDH10Q9P2E7 MILR1-204ENST00000616498 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PCDH10Q9P2E7 Metazoa_SRP.193-201ENST00000622007 277 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PCDH10Q9P2E7 LINC00630-201ENST00000416381 2012 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PCDH10Q9P2E7 ZNF148-201ENST00000360647 9651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PCDH10Q9P2E7 ZRANB3-211ENST00000619650 2494 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PCDH10Q9P2E7 CU633906.1-201ENST00000621924 2380 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PCDH10Q9P2E7 ANKRD49-208ENST00000544253 3002 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PCDH10Q9P2E7 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PCDH10Q9P2E7 TCF12-207ENST00000557843 4076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PCDH10Q9P2E7 SCN9A-202ENST00000409435 5967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PCDH10Q9P2E7 ZNF573-217ENST00000590414 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PCDH10Q9P2E7 FKBP5-202ENST00000536438 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PCDH10Q9P2E7 KIAA1841-205ENST00000453873 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PCDH10Q9P2E7 APP-206ENST00000359726 3294 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PCDH10Q9P2E7 AC009948.5-201ENST00000624360 4406 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PCDH10Q9P2E7 RAI14-208ENST00000506376 3091 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PCDH10Q9P2E7 FGFR2-205ENST00000357555 3690 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PCDH10Q9P2E7 LSM8-204ENST00000424702 4030 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PCDH10Q9P2E7 EIF4G2-208ENST00000526148 4001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PCDH10Q9P2E7 NOVA1-204ENST00000465357 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PCDH10Q9P2E7 AC019270.1-201ENST00000523495 3488 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PCDH10Q9P2E7 OR51A10P-201ENST00000307165 937 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PCDH10Q9P2E7 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PCDH10Q9P2E7 RNU6-1017P-201ENST00000363613 106 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PCDH10Q9P2E7 S100A5-201ENST00000368717 506 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PCDH10Q9P2E7 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PCDH10Q9P2E7 RPS6P23-201ENST00000413224 722 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PCDH10Q9P2E7 LINC00362-201ENST00000414345 264 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PCDH10Q9P2E7 AL138831.1-201ENST00000415144 209 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PCDH10Q9P2E7 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PCDH10Q9P2E7 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PCDH10Q9P2E7 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PCDH10Q9P2E7 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PCDH10Q9P2E7 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PCDH10Q9P2E7 AC106785.4-201ENST00000569492 412 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
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PCDH10Q9P2E7 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PCDH10Q9P2E7 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PCDH10Q9P2E7 MIR4701-201ENST00000583094 63 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PCDH10Q9P2E7 AC145423.1-201ENST00000605712 336 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PCDH10Q9P2E7 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PCDH10Q9P2E7 FAM27E2-201ENST00000619668 403 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PCDH10Q9P2E7 MIR6811-201ENST00000620409 58 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PCDH10Q9P2E7 CACNB2-215ENST00000615785 3707 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PCDH10Q9P2E7 LY75-201ENST00000263636 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PCDH10Q9P2E7 DAZ3-202ENST00000382365 3503 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PCDH10Q9P2E7 ZNF519-207ENST00000590202 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PCDH10Q9P2E7 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PCDH10Q9P2E7 TAF7L-201ENST00000324762 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PCDH10Q9P2E7 SYNPO2-202ENST00000429713 9920 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PCDH10Q9P2E7 C18orf54-206ENST00000620105 5693 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PCDH10Q9P2E7 AC027575.3-201ENST00000583058 2747 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PCDH10Q9P2E7 STAG1-201ENST00000236698 5951 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PCDH10Q9P2E7 TPRG1-204ENST00000433971 2296 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
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PCDH10Q9P2E7 RPGRIP1L-202ENST00000379925 5297 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PCDH10Q9P2E7 RAB23-201ENST00000317483 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PCDH10Q9P2E7 EZH1-222ENST00000592743 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PCDH10Q9P2E7 LRRC37A-201ENST00000320254 5177 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PCDH10Q9P2E7 NBPF26-204ENST00000615145 2656 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PCDH10Q9P2E7 OR13C1P-202ENST00000641378 2919 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PCDH10Q9P2E7 MKKS-201ENST00000347364 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PCDH10Q9P2E7 FOXP2-226ENST00000635638 2598 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PCDH10Q9P2E7 ALG13-224ENST00000610588 4175 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PCDH10Q9P2E7 EHBP1-203ENST00000405289 3591 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PCDH10Q9P2E7 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PCDH10Q9P2E7 MBNL2-203ENST00000376673 4632 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PCDH10Q9P2E7 SPAG6-209ENST00000538630 2376 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PCDH10Q9P2E7 AC068870.3-201ENST00000625077 2536 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PCDH10Q9P2E7 HTR2A-203ENST00000543956 4689 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PCDH10Q9P2E7 LCP1-202ENST00000398576 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PCDH10Q9P2E7 MAPK6-201ENST00000261845 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PCDH10Q9P2E7 LINC01108-201ENST00000427276 3152 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PCDH10Q9P2E7 TMEM200A-203ENST00000545622 2918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PCDH10Q9P2E7 SNORA38B-201ENST00000363524 131 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PCDH10Q9P2E7 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PCDH10Q9P2E7 SPRR2E-202ENST00000368751 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PCDH10Q9P2E7 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PCDH10Q9P2E7 TRBV23-1-201ENST00000390396 347 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PCDH10Q9P2E7 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PCDH10Q9P2E7 AC244452.1-201ENST00000413798 141 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PCDH10Q9P2E7 AL133268.2-201ENST00000416595 430 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PCDH10Q9P2E7 AC092634.6-201ENST00000418558 192 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PCDH10Q9P2E7 AC012065.2-201ENST00000421295 375 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PCDH10Q9P2E7 AC004870.2-202ENST00000423781 706 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PCDH10Q9P2E7 STXBP5-AS1-204ENST00000431143 644 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PCDH10Q9P2E7 TXNP5-201ENST00000441043 315 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PCDH10Q9P2E7 AL161629.1-201ENST00000446201 457 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
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