Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYP9

KRTAP9-9, Keratin-associated protein 9-9, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-9Q9BYP9 SORBS1-203ENST00000354106 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 LPA-203ENST00000614786 1713 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 DZIP1-202ENST00000361156 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 METTL2B-204ENST00000480046 5743 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 GPR155-203ENST00000392552 6730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF423-201ENST00000262383 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 REL-201ENST00000295025 11255 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 SGSM2-211ENST00000574563 3410 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 AC025031.4-201ENST00000621248 3271 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 KLHL3-209ENST00000508657 6981 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 CACNB4-233ENST00000636773 4143 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 SYVN1-206ENST00000526060 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 DGKZ-220ENST00000532868 3118 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 PLEC-207ENST00000398774 14646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 NTNG2-201ENST00000372179 3984 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 TTLL5-202ENST00000298832 4683 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 U3.3-201ENST00000362986 216 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 RNA5SP263-201ENST00000363376 128 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 RNU6-810P-201ENST00000364001 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 SNORA70.2-201ENST00000364506 135 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 MRPL55-211ENST00000366738 705 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 MRPL55-216ENST00000366744 726 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 S100A5-201ENST00000368717 506 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR646-201ENST00000385067 94 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 IGLV11-55-201ENST00000390286 381 ntAPPRIS P1 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 TRAV12-1-201ENST00000390433 340 ntAPPRIS P1 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 IGHV2-5-201ENST00000390597 378 ntAPPRIS P1 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR301B-201ENST00000390813 78 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 MRPL52-204ENST00000397505 333 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 AC087491.1-201ENST00000398554 616 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR548H4-201ENST00000408689 111 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 AL117378.1-202ENST00000421310 601 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 AC134879.1-201ENST00000426062 394 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 LINC01716-202ENST00000437350 298 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 RN7SL359P-201ENST00000473502 288 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 AC087385.2-201ENST00000477729 498 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 ADAM9-209ENST00000487273 3839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 RNA5SP360-201ENST00000516555 118 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 RNA5SP460-201ENST00000516789 100 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 LINC02489-201ENST00000527239 354 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 AC011611.6-201ENST00000547483 255 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 IGHV4OR15-8-201ENST00000557788 353 ntAPPRIS P1 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 AC096996.2-201ENST00000563906 426 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 AC243312.1-201ENST00000570582 275 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 Metazoa_SRP.121-201ENST00000578843 303 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 AC005856.1-201ENST00000585921 286 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 AC024220.1-201ENST00000603675 484 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 RNU1-30P-201ENST00000606575 163 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 RN7SL627P-201ENST00000620534 303 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 AL359741.1-201ENST00000621262 225 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 AC135068.2-201ENST00000622410 353 ntAPPRIS P1 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 AC009093.8-201ENST00000641769 292 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 SRRM1-203ENST00000447431 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 AL353770.3-201ENST00000616253 1988 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 PLCH1-206ENST00000494598 3525 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 OR8G1-202ENST00000641972 5055 ntAPPRIS P1 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 CDX2-201ENST00000381020 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 C5orf56-201ENST00000337752 4767 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 CEP85-201ENST00000252992 3935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 DTX2P1-UPK3BP1-PMS2P11-203ENST00000636308 4646 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 BSN-201ENST00000296452 15955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 CAPZA2-201ENST00000361183 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 AC079466.1-201ENST00000587961 4453 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 CEP68-205ENST00000537589 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 NLRP8-202ENST00000590542 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 QARS-209ENST00000464962 2362 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 CACNB3-204ENST00000547230 2395 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 ACSL4-202ENST00000348502 5032 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 PARM1-202ENST00000513238 4308 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 NCKAP1L-202ENST00000545638 3612 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 BTN2A1-201ENST00000312541 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 TUFT1-204ENST00000392712 2946 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 AC106038.1-201ENST00000501194 3473 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF322-202ENST00000456172 4718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 STAT3-213ENST00000588969 2772 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 TYW1-201ENST00000359626 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 TIMP2-203ENST00000585421 3345 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 STAT3-211ENST00000585517 3319 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.5 ms