Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 SNORA51.9-201ENST00000384295 124 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-1151P-201ENST00000384684 107 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 RNU11-201ENST00000387069 134 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 RNA5SP178-201ENST00000410380 128 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 AC092634.6-201ENST00000418558 192 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 AC094019.1-201ENST00000434678 472 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 AC005487.1-201ENST00000440208 665 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 AL450996.1-201ENST00000445574 1202 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 RPL23AP15-201ENST00000450202 459 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 AC017101.1-201ENST00000453665 571 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 AC011005.3-201ENST00000491624 395 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-488P-201ENST00000515918 99 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 HIGD1AP5-201ENST00000529959 259 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 AC079905.1-201ENST00000549280 475 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 OTX2-203ENST00000554559 715 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 AC007952.9-201ENST00000584365 191 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 Z98949.1-204ENST00000595102 731 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 AL360012.1-201ENST00000602813 131 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 AL080312.2-201ENST00000613001 630 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 ZNHIT3-208ENST00000619730 926 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 AC127024.6-201ENST00000621598 424 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 CDH9-201ENST00000231021 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 VCAN-202ENST00000342785 7154 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 AC109811.1-201ENST00000512833 2807 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 LGI1-228ENST00000637689 1802 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 DCLK1-208ENST00000615680 7592 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 FCF1-201ENST00000341162 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 AP002512.4-202ENST00000641599 4530 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 EMCN-201ENST00000296420 4037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 USPL1-203ENST00000614860 4074 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 CASC17-201ENST00000569074 2059 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 TTC3-201ENST00000354749 9084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 NRCAM-204ENST00000379028 6685 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 FANCD2-205ENST00000431693 2450 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 PTPRZ1-201ENST00000393386 8175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 MEG8-223ENST00000638012 3757 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 AC104837.1-201ENST00000444644 1587 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 MIR323A-201ENST00000362199 86 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 MIR506-201ENST00000384998 124 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 EIF4A1P7-201ENST00000421800 1220 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 AC008065.1-201ENST00000428525 348 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 RPL23AP89-201ENST00000439324 255 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 CRYGGP-201ENST00000443337 145 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 LINC01072-201ENST00000455848 431 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 FO393408.1-201ENST00000458577 582 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 AC083829.1-201ENST00000503756 657 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 SNX18P24-201ENST00000505249 671 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 AC113349.1-201ENST00000512105 583 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 RNA5SP271-201ENST00000516700 88 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 IGKV3D-25-201ENST00000519599 235 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 AF279873.1-201ENST00000523393 313 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 RPA2P1-201ENST00000556557 721 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 AC073878.2-201ENST00000565449 385 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 AC004917.1-204ENST00000592441 701 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 AC020765.1-201ENST00000604296 328 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 LY86-AS1-206ENST00000607278 677 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 OR10A6-202ENST00000623991 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 SORCS1-210ENST00000622431 6701 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 SYTL4-203ENST00000372981 4847 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
SPOCK3Q9BQ16 AC099062.1-202ENST00000640362 3864 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
SPOCK3Q9BQ16 GABRG2-203ENST00000414552 3927 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
SPOCK3Q9BQ16 MAGT1-204ENST00000610432 4019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
SPOCK3Q9BQ16 RXFP1-206ENST00000460056 2735 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
SPOCK3Q9BQ16 MYO16-201ENST00000251041 3492 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
SPOCK3Q9BQ16 PDE11A-212ENST00000358450 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
SPOCK3Q9BQ16 ADGRB3-203ENST00000546190 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107 ms