Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 AC009480.2-201ENST00000422916 432 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 ZMYM4-AS1-201ENST00000432683 459 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 AC006333.1-202ENST00000440504 555 ntTSL 4 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 AL033380.1-201ENST00000442781 421 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 EXOSC3P1-201ENST00000448649 500 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 AC010891.1-201ENST00000449963 448 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 RPS11P1-201ENST00000451072 473 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 RPS29P33-201ENST00000456717 146 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 ARPC3P2-201ENST00000457786 533 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 AC097493.1-201ENST00000463958 372 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 GUCA1C-203ENST00000471108 633 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 AL132838.2-201ENST00000492041 314 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 AC119751.4-201ENST00000507498 357 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 AC010374.2-201ENST00000512933 535 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 LINC02143-201ENST00000519929 520 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 AC011853.2-201ENST00000526901 774 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 CYCSP29-201ENST00000533731 318 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 AC073651.3-201ENST00000545999 417 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 AC117377.1-201ENST00000547633 1038 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 PWRN1-202ENST00000562501 642 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 AC090371.2-203ENST00000578782 473 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 TTN-AS1-228ENST00000589234 751 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 SNORA51-201ENST00000606420 132 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 AL451074.6-201ENST00000608512 729 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 KLRF1-207ENST00000617793 1096 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 WASF3-AS1-206ENST00000626779 381 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 LINC02086-205ENST00000628749 679 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 RAB3C-201ENST00000282878 8896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 CEP170-202ENST00000366542 6828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 PPHLN1-208ENST00000449194 1583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 SPZ1-201ENST00000296739 1868 ntAPPRIS P2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 PRKACB-208ENST00000394839 4200 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 PRKACB-202ENST00000370682 4288 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 RNU4-68P-201ENST00000364314 141 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 FAM24A-201ENST00000368894 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 DFNB59-201ENST00000375129 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 Y_RNA.408-201ENST00000383987 102 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
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SCARB2Q14108 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
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SCARB2Q14108 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 LINC02089-201ENST00000412360 682 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
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SCARB2Q14108 AC239803.1-202ENST00000432038 590 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
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SCARB2Q14108 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
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SCARB2Q14108 RN7SL93P-201ENST00000463035 293 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 AC105137.1-201ENST00000484355 562 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 SATB1-216ENST00000491519 1000 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 SLIT2-IT1-201ENST00000515882 601 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 THEM7P-202ENST00000525689 764 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 LINC02378-201ENST00000540399 1003 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
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SCARB2Q14108 AC068875.1-201ENST00000561054 463 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 AP001269.3-201ENST00000588718 329 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 AC011330.2-201ENST00000621680 635 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 MIR6730-201ENST00000622213 67 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 FRYL-205ENST00000503238 11103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 TMCO5A-203ENST00000558158 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 SLC35A1-201ENST00000369552 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC3.65□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 MTCO1P9-201ENST00000505577 1534 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 MS4A14-208ENST00000531783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
SCARB2Q14108 OR6A2-202ENST00000641196 4295 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 DEFB108B-201ENST00000328698 222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 RNU1-18P-201ENST00000363062 164 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 Y_RNA.311-201ENST00000365068 96 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 PARD3-204ENST00000374768 799 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 Y_RNA.465-201ENST00000384293 102 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 LINC00279-201ENST00000413486 473 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 TPMTP2-201ENST00000414372 726 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 AL357375.1-201ENST00000424274 525 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SCARB2Q14108 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
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