Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 RPL7P6-201ENST00000480903 738 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 SCARNA6.1-201ENST00000516989 238 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 AC027308.1-201ENST00000517993 110 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 AC090809.1-201ENST00000524132 570 ntTSL 4 BASIC6.41□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 AP001267.3-204ENST00000528578 423 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 CYCSP28-201ENST00000534284 321 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 AC005670.2-201ENST00000571841 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 MIR4260-201ENST00000583107 67 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 AC007952.9-201ENST00000584365 191 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 GMFG-202ENST00000594700 397 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 GMFG-212ENST00000602185 423 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 AL008729.2-201ENST00000606393 473 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 AC074140.1-201ENST00000621617 208 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 OR10A6-202ENST00000623991 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 UBA3-213ENST00000631029 123 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 ZNF271P-205ENST00000639248 4573 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 FAT4-202ENST00000394329 16123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 UGT2B15-201ENST00000338206 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 TXNDC8-201ENST00000374507 1787 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 AC097063.1-201ENST00000426714 1797 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 FAM35A-201ENST00000298784 3402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 AC048341.2-201ENST00000550290 8693 ntTSL 4 BASIC6.41□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 OR2T29-202ENST00000641069 2637 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 TMOD2-201ENST00000249700 9191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 KIF2A-203ENST00000407818 2315 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 ZNF506-201ENST00000443905 4095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 DGKB-201ENST00000399322 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 ARHGAP21-202ENST00000376410 3526 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 ADGRF1-203ENST00000371253 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 FCRL2-203ENST00000368181 1669 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 LINC00919-201ENST00000561513 1658 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 AC092378.1-202ENST00000500117 2296 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 MT-ND3-201ENST00000361227 346 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 GNG5P2-201ENST00000372054 207 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 AC008164.1-201ENST00000423925 564 ntTSL 4 BASIC6.4□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 Z82246.1-201ENST00000428201 457 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 RPS3AP54-201ENST00000435535 734 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 AC004837.2-201ENST00000435766 731 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 RPS12P17-201ENST00000438591 377 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 AL663074.2-201ENST00000440621 479 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 AC099344.3-201ENST00000454489 626 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 NF1P3-201ENST00000457709 450 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 AC103987.1-201ENST00000473394 348 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 AC090453.1-201ENST00000495560 436 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 RNU6-615P-201ENST00000516065 106 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 IGKV2-19-201ENST00000518132 283 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 AC079209.1-202ENST00000521953 522 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 IGBP1P1-201ENST00000554337 1009 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 AL049872.1-201ENST00000556323 322 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 FRMD6-AS2-201ENST00000556617 548 ntTSL 4 BASIC6.4□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 MIR132-201ENST00000591554 101 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 Z98949.1-204ENST00000595102 731 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 AP001972.3-202ENST00000603012 375 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 AC104662.1-201ENST00000604448 511 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 AC010424.2-201ENST00000607594 443 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 337 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 AC069234.4-201ENST00000621276 412 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 IKZF3-210ENST00000377958 1837 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
NFX1Q12986 NRDC-213ENST00000539524 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
NFX1Q12986 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
NFX1Q12986 CLCN3-201ENST00000347613 3635 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
NFX1Q12986 ZNF195-201ENST00000005082 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
NFX1Q12986 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
NFX1Q12986 TNFSF4-201ENST00000281834 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
NFX1Q12986 ADAM18-202ENST00000379866 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
NFX1Q12986 TRPM6-202ENST00000360774 8425 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
NFX1Q12986 PDE4D-202ENST00000317118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
NFX1Q12986 MTTP-203ENST00000457717 4092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
NFX1Q12986 RPE65-201ENST00000262340 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
NFX1Q12986 AP4S1-212ENST00000622409 4113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
NFX1Q12986 AC092329.3-201ENST00000611392 1904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
NFX1Q12986 SCAPER-207ENST00000563290 5028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
NFX1Q12986 AL591135.1-201ENST00000401578 5914 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
NFX1Q12986 AL606537.1-201ENST00000607258 2011 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
NFX1Q12986 AC067956.1-201ENST00000414512 2062 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
NFX1Q12986 RN7SKP162-201ENST00000363605 345 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
NFX1Q12986 RNA5SP132-201ENST00000364725 118 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
NFX1Q12986 ZRSR2-202ENST00000380308 744 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
NFX1Q12986 HORMAD2-202ENST00000403975 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
NFX1Q12986 AP000580.1-201ENST00000404439 358 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
NFX1Q12986 MIR1178-201ENST00000408396 91 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
NFX1Q12986 RNA5SP345-201ENST00000410646 108 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
NFX1Q12986 EEF1A1P29-201ENST00000416082 1096 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
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