Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 FO393422.1-201ENST00000603908 708 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 AC104695.2-201ENST00000605056 775 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 STARD13-AS-221ENST00000608197 604 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 MIR8069-1-201ENST00000616627 86 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 337 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 MIR8069-2-201ENST00000621412 86 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 PLCE1P1-201ENST00000622094 305 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 Metazoa_SRP.93-201ENST00000622525 276 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 AC135584.1-201ENST00000624438 333 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 NRG1-220ENST00000539990 2401 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 GLIPR1L2-202ENST00000378692 1903 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 SPART-201ENST00000355182 4820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 AL033397.1-201ENST00000502390 3653 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 PHC3-215ENST00000495893 12666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 CMYA5-201ENST00000446378 12847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 IFI16-208ENST00000448393 2245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 SLC30A6-203ENST00000379343 2354 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 AC107068.1-201ENST00000563286 4218 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 FAP-214ENST00000627638 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 NFIB-203ENST00000380934 2142 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 OR56B2P-202ENST00000641377 2453 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 FAM162A-201ENST00000232125 801 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 TATDN1-201ENST00000276692 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 COX7B2-201ENST00000355591 542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 CENPW-203ENST00000368328 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 RNU1-77P-201ENST00000390868 162 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 NUDT19P3-201ENST00000404698 555 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 SEPT2P1-201ENST00000419651 180 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 AL133325.1-201ENST00000421090 382 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 AL365338.1-201ENST00000422282 858 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 AL512656.1-201ENST00000427492 401 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 UTS2B-203ENST00000427544 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 AC008269.1-201ENST00000438070 646 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 AL117336.1-201ENST00000439198 380 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 USP9YP29-201ENST00000445112 563 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 RPL36AP39-201ENST00000445859 318 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 DPP10-AS2-201ENST00000446992 624 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 MTND1P12-201ENST00000455231 147 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 Z92846.1-201ENST00000456203 268 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 MTND2P28-201ENST00000457540 1044 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 RNU6-956P-201ENST00000458868 103 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 RN7SL168P-201ENST00000463821 279 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 TSACC-207ENST00000470342 601 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 AC007998.1-201ENST00000474156 672 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 SIAH1P1-201ENST00000479411 923 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 AC041039.1-201ENST00000485656 536 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 AC092994.1-201ENST00000498604 279 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 PTPN20-213ENST00000502705 854 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 AK3P4-201ENST00000504283 583 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 AC092673.1-201ENST00000510203 428 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 RPS3A-210ENST00000512690 845 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 AC106744.2-202ENST00000515123 448 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 AC091819.1-201ENST00000518330 630 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 AC040914.1-201ENST00000518674 318 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 HIGD1AP5-201ENST00000529959 259 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 AC005868.1-201ENST00000536421 331 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 LINC02400-201ENST00000548210 351 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 AC079598.1-201ENST00000548691 554 ntTSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 AC012464.2-201ENST00000551257 779 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 AC124947.2-202ENST00000552735 133 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 RNASE9-206ENST00000554964 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 MRO-208ENST00000588444 866 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 Z98949.1-203ENST00000597284 851 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 CKS1BP3-201ENST00000600888 237 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 AC068790.5-201ENST00000602741 355 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 AC002128.2-201ENST00000604161 618 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 AC080013.6-201ENST00000606185 215 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 AC009093.5-201ENST00000620963 359 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 C1orf195-202ENST00000625027 441 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107 ms