Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ6

KRTAP4-11, Keratin-associated protein 4-11, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-11Q9BYQ6 snoZ6.4-201ENST00000581669 55 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 AC007448.1-201ENST00000582714 234 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 AC020914.7-201ENST00000594477 545 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 OR7A18P-201ENST00000600416 277 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 5_8S_rRNA.2-201ENST00000612732 151 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 7SK.12-201ENST00000612820 244 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 AC245033.3-201ENST00000617986 224 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 AL118508.2-201ENST00000622708 673 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 HBG1-202ENST00000632727 369 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 MIR3120-201ENST00000636555 81 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 OGDH-205ENST00000444676 3309 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 PCBP1-AS1-210ENST00000416395 2451 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 ZNF587-202ENST00000419854 5731 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 TMEM144-216ENST00000514558 3699 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 RSPH4A-201ENST00000229554 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 PLAC4-201ENST00000623119 5588 ntAPPRIS P1 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 AC006030.1-201ENST00000451608 5059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 KCTD7-207ENST00000639879 5098 ntTSL 4 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 MEP1B-201ENST00000269202 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 SLC7A8-204ENST00000422941 3018 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 OGDHL-203ENST00000432695 3383 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 RABGEF1-201ENST00000284957 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 CSPG4P4Y-201ENST00000333235 3724 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 CSPG4P3Y-201ENST00000418188 3724 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 PTPRA-202ENST00000318266 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 ADGRG1-201ENST00000388813 3925 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 PCDHGA1-202ENST00000517417 4604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 EIF4G2-232ENST00000640650 2724 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 ZNF473-201ENST00000270617 4688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 ZIC4-201ENST00000383075 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 TRMO-207ENST00000611338 3635 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 GJC1-201ENST00000330514 3295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 ZCCHC8-201ENST00000536306 2904 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 MCM10-202ENST00000378714 4547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 C2orf71-201ENST00000331664 7044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 MROH7-201ENST00000339553 3459 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 ZFY-204ENST00000449237 3464 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 ZNF608-201ENST00000306315 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 DCANP1-201ENST00000503143 3135 ntAPPRIS P1 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 SLC12A3-205ENST00000566786 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 HK2-202ENST00000409174 5278 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 WIPF3-203ENST00000409290 4002 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 PIGN-221ENST00000638183 4046 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 BRDT-203ENST00000370389 3696 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 ACOT11-202ENST00000371316 6369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 STAT3-211ENST00000585517 3319 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 MIGA1-202ENST00000443751 6409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 SYNPR-201ENST00000295894 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 GPRC6A-202ENST00000368549 2622 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 KCNK10-203ENST00000340700 7501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 PEX5-202ENST00000266564 3170 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 OR9I1-202ENST00000641439 3184 ntAPPRIS P1 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 AC007114.2-201ENST00000576014 4281 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 MYO1F-222ENST00000613525 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 MSRB3-212ENST00000614640 4270 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 NVL-203ENST00000391875 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 GABRR1-203ENST00000454853 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 ZNF705D-202ENST00000400085 3377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 ESRRG-219ENST00000487276 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 NELL2-212ENST00000549027 3036 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 RAB18-201ENST00000356940 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 JDP2-204ENST00000437176 3775 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 PIP5K1B-201ENST00000265382 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 NCAPD3-214ENST00000534548 5061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 UBAP2L-201ENST00000271877 3997 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 ZNF215-201ENST00000278319 3448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 CTNND1-210ENST00000524630 6553 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 STK36-207ENST00000440309 4721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 FRMD7-202ENST00000370879 2864 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 CUL1-202ENST00000409469 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 STK16-204ENST00000409638 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 STAG3-201ENST00000317296 4198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 DHCR24-203ENST00000535035 4153 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 ZNF442-201ENST00000242804 6219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 TIMELESS-203ENST00000553532 5121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 FGFR2-213ENST00000369061 3803 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 CREB3L4-201ENST00000271889 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 CYP24A1-201ENST00000216862 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 SENP7-202ENST00000348610 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 SETD4-206ENST00000399212 3258 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 AL354993.1-201ENST00000436286 3280 ntTSL 4 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 WRAP53-201ENST00000316024 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 NRAP-204ENST00000369360 5535 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 PCDH15-203ENST00000373955 4230 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 PUS7-201ENST00000356362 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 WDR75-201ENST00000314761 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 FGFR1-209ENST00000397113 3680 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 BMPR1B-208ENST00000515059 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 TANGO6-201ENST00000261778 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 AC005618.1-201ENST00000606901 3148 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 TTC23-201ENST00000262074 3316 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 PAICS-201ENST00000264221 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 GTF2IP7-201ENST00000434037 2399 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 SUB1-201ENST00000265073 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 SIPA1L2-201ENST00000262861 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP4-11Q9BYQ6 NAP1L3-202ENST00000475430 2555 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 154.1 ms