Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 AC099563.1-201ENST00000456086 418 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 BTF3P5-201ENST00000457252 467 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 AL445488.1-201ENST00000457272 706 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 RHOBTB3-204ENST00000504179 883 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 AC022784.3-202ENST00000517816 826 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 AC010376.1-201ENST00000522101 334 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 OR7E13P-201ENST00000526052 910 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 HIGD1AP10-201ENST00000527837 282 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 AL133372.3-201ENST00000553082 821 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 AL160237.1-201ENST00000554526 572 ntTSL 4 BASIC3.64□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 IGKV2OR2-8-201ENST00000558710 300 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 MIR3912-201ENST00000577566 105 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 AC006130.2-201ENST00000586202 326 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 RNASEH2B-AS1-202ENST00000593369 648 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 AC069545.1-201ENST00000605671 358 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 AL391497.1-201ENST00000608671 547 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 AC034229.5-201ENST00000624258 185 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 AP000553.6-201ENST00000641242 118 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 GLCE-202ENST00000559420 4840 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 MBD5-212ENST00000627651 5610 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 PLAG1-201ENST00000316981 7322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 RNF38-210ENST00000611646 5185 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 LINC00561-201ENST00000565815 2738 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 IL23R-202ENST00000395227 1459 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 TFPI-202ENST00000339091 1088 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 U8.11-201ENST00000384699 133 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 U8.12-201ENST00000384701 133 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 HMGN2P8-201ENST00000391458 268 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 AC025750.1-201ENST00000399891 379 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 P4HA2-AS1-201ENST00000417667 839 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
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RPA4Q13156 AL023693.1-201ENST00000434255 216 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
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RPA4Q13156 LINC00977-201ENST00000509893 1163 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
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RPA4Q13156 LARP7P2-201ENST00000575306 125 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 AP005433.1-201ENST00000582939 620 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
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RPA4Q13156 RNF38-203ENST00000353739 4945 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
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RPA4Q13156 SGO1P2-201ENST00000429458 1589 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 HPGDS-201ENST00000295256 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 CEP170-202ENST00000366542 6828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 ZNF726-205ENST00000575986 1522 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 DEFB110-201ENST00000371148 384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 PARD3-204ENST00000374768 799 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 SOD2P1-201ENST00000396543 562 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 C1GALT1-202ENST00000402468 930 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 HNMT-204ENST00000410115 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 AL049765.1-201ENST00000416237 573 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 LINC01349-201ENST00000416343 497 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 AC007435.1-201ENST00000421086 415 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 GLRXP1-201ENST00000423261 334 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 USP9YP31-201ENST00000431405 881 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 AL354977.1-201ENST00000438147 679 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 AC019330.1-202ENST00000440609 504 ntTSL 4 BASIC3.62□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 AC096558.1-202ENST00000442794 561 ntTSL 4 BASIC3.62□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 AF127577.1-201ENST00000446301 562 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 USP9YP34-201ENST00000453983 808 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
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