Protein–RNA interactions for Protein: S4R3C0

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S4R3C0 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
S4R3C0 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
S4R3C0 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
S4R3C0 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
S4R3C0 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
S4R3C0 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
S4R3C0 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
S4R3C0 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
S4R3C0 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
S4R3C0 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
S4R3C0 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
S4R3C0 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
S4R3C0 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
S4R3C0 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
S4R3C0 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
S4R3C0 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
S4R3C0 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
S4R3C0 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
S4R3C0 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
S4R3C0 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
S4R3C0 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
S4R3C0 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
S4R3C0 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
S4R3C0 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
S4R3C0 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
S4R3C0 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
S4R3C0 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
S4R3C0 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
S4R3C0 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
S4R3C0 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
S4R3C0 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
S4R3C0 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
S4R3C0 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
S4R3C0 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
S4R3C0 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
S4R3C0 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
S4R3C0 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
S4R3C0 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
S4R3C0 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
S4R3C0 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
S4R3C0 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
S4R3C0 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
S4R3C0 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
S4R3C0 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
S4R3C0 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
S4R3C0 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
S4R3C0 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
S4R3C0 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
S4R3C0 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
S4R3C0 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
S4R3C0 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
S4R3C0 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
S4R3C0 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
S4R3C0 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
S4R3C0 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
S4R3C0 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
S4R3C0 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
S4R3C0 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
S4R3C0 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
S4R3C0 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
S4R3C0 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
S4R3C0 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
S4R3C0 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
S4R3C0 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
S4R3C0 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
S4R3C0 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
S4R3C0 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
S4R3C0 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
S4R3C0 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
S4R3C0 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
S4R3C0 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
S4R3C0 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
S4R3C0 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
S4R3C0 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
S4R3C0 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
S4R3C0 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
S4R3C0 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
S4R3C0 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
S4R3C0 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
S4R3C0 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
S4R3C0 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
S4R3C0 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
S4R3C0 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
S4R3C0 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
S4R3C0 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
S4R3C0 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
S4R3C0 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
S4R3C0 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
S4R3C0 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
S4R3C0 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
S4R3C0 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
S4R3C0 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
S4R3C0 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
S4R3C0 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
S4R3C0 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
S4R3C0 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
S4R3C0 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
S4R3C0 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
S4R3C0 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
S4R3C0 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms