Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y7

LYVE1, Lymphatic vessel endothelial hyaluronic acid receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYVE1Q9Y5Y7 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LYVE1Q9Y5Y7 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LYVE1Q9Y5Y7 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
LYVE1Q9Y5Y7 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LYVE1Q9Y5Y7 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LYVE1Q9Y5Y7 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LYVE1Q9Y5Y7 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LYVE1Q9Y5Y7 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LYVE1Q9Y5Y7 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LYVE1Q9Y5Y7 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LYVE1Q9Y5Y7 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LYVE1Q9Y5Y7 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LYVE1Q9Y5Y7 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LYVE1Q9Y5Y7 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LYVE1Q9Y5Y7 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LYVE1Q9Y5Y7 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LYVE1Q9Y5Y7 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LYVE1Q9Y5Y7 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
LYVE1Q9Y5Y7 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LYVE1Q9Y5Y7 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LYVE1Q9Y5Y7 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LYVE1Q9Y5Y7 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LYVE1Q9Y5Y7 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LYVE1Q9Y5Y7 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LYVE1Q9Y5Y7 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LYVE1Q9Y5Y7 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LYVE1Q9Y5Y7 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LYVE1Q9Y5Y7 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LYVE1Q9Y5Y7 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LYVE1Q9Y5Y7 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LYVE1Q9Y5Y7 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms