Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SNX13Q9Y5W8 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SNX13Q9Y5W8 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SNX13Q9Y5W8 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SNX13Q9Y5W8 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SNX13Q9Y5W8 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SNX13Q9Y5W8 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SNX13Q9Y5W8 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SNX13Q9Y5W8 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SNX13Q9Y5W8 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SNX13Q9Y5W8 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
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SNX13Q9Y5W8 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
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SNX13Q9Y5W8 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
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