Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B6

PAXBP1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXBP1Q9Y5B6 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms