Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q9Y3F1 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q9Y3F1 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q9Y3F1 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q9Y3F1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q9Y3F1 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q9Y3F1 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q9Y3F1 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Q9Y3F1 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q9Y3F1 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q9Y3F1 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q9Y3F1 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q9Y3F1 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Q9Y3F1 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Q9Y3F1 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Q9Y3F1 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Q9Y3F1 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q9Y3F1 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q9Y3F1 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q9Y3F1 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Q9Y3F1 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q9Y3F1 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q9Y3F1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Q9Y3F1 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Q9Y3F1 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Q9Y3F1 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q9Y3F1 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q9Y3F1 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q9Y3F1 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Q9Y3F1 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q9Y3F1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q9Y3F1 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q9Y3F1 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Q9Y3F1 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Q9Y3F1 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Q9Y3F1 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Q9Y3F1 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Q9Y3F1 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q9Y3F1 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q9Y3F1 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q9Y3F1 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q9Y3F1 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q9Y3F1 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q9Y3F1 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Q9Y3F1 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q9Y3F1 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Q9Y3F1 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Q9Y3F1 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q9Y3F1 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q9Y3F1 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q9Y3F1 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Q9Y3F1 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Q9Y3F1 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q9Y3F1 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Q9Y3F1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q9Y3F1 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q9Y3F1 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q9Y3F1 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q9Y3F1 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Q9Y3F1 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Q9Y3F1 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Q9Y3F1 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Q9Y3F1 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Q9Y3F1 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Q9Y3F1 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Q9Y3F1 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Q9Y3F1 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q9Y3F1 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q9Y3F1 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q9Y3F1 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q9Y3F1 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q9Y3F1 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q9Y3F1 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q9Y3F1 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q9Y3F1 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q9Y3F1 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q9Y3F1 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q9Y3F1 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q9Y3F1 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q9Y3F1 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q9Y3F1 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q9Y3F1 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Q9Y3F1 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q9Y3F1 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q9Y3F1 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q9Y3F1 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q9Y3F1 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q9Y3F1 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q9Y3F1 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q9Y3F1 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q9Y3F1 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Q9Y3F1 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q9Y3F1 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q9Y3F1 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q9Y3F1 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q9Y3F1 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q9Y3F1 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q9Y3F1 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q9Y3F1 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q9Y3F1 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms