Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HDGFL3Q9Y3E1 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HDGFL3Q9Y3E1 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms