Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W1

THRAP3, Thyroid hormone receptor-associated protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRAP3Q9Y2W1 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
THRAP3Q9Y2W1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
THRAP3Q9Y2W1 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
THRAP3Q9Y2W1 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
THRAP3Q9Y2W1 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
THRAP3Q9Y2W1 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
THRAP3Q9Y2W1 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
THRAP3Q9Y2W1 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
THRAP3Q9Y2W1 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
THRAP3Q9Y2W1 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
THRAP3Q9Y2W1 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
THRAP3Q9Y2W1 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
THRAP3Q9Y2W1 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
THRAP3Q9Y2W1 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
THRAP3Q9Y2W1 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
THRAP3Q9Y2W1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
THRAP3Q9Y2W1 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
THRAP3Q9Y2W1 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
THRAP3Q9Y2W1 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
THRAP3Q9Y2W1 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
THRAP3Q9Y2W1 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
THRAP3Q9Y2W1 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
THRAP3Q9Y2W1 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
THRAP3Q9Y2W1 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
THRAP3Q9Y2W1 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
THRAP3Q9Y2W1 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
THRAP3Q9Y2W1 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
THRAP3Q9Y2W1 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
THRAP3Q9Y2W1 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
THRAP3Q9Y2W1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
THRAP3Q9Y2W1 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
THRAP3Q9Y2W1 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
THRAP3Q9Y2W1 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
THRAP3Q9Y2W1 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
THRAP3Q9Y2W1 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
THRAP3Q9Y2W1 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
THRAP3Q9Y2W1 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
THRAP3Q9Y2W1 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
THRAP3Q9Y2W1 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
THRAP3Q9Y2W1 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
THRAP3Q9Y2W1 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
THRAP3Q9Y2W1 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
THRAP3Q9Y2W1 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
THRAP3Q9Y2W1 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
THRAP3Q9Y2W1 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
THRAP3Q9Y2W1 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
THRAP3Q9Y2W1 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
THRAP3Q9Y2W1 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
THRAP3Q9Y2W1 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
THRAP3Q9Y2W1 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
THRAP3Q9Y2W1 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
THRAP3Q9Y2W1 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
THRAP3Q9Y2W1 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
THRAP3Q9Y2W1 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
THRAP3Q9Y2W1 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
THRAP3Q9Y2W1 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
THRAP3Q9Y2W1 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
THRAP3Q9Y2W1 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
THRAP3Q9Y2W1 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
THRAP3Q9Y2W1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
THRAP3Q9Y2W1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
THRAP3Q9Y2W1 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
THRAP3Q9Y2W1 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
THRAP3Q9Y2W1 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
THRAP3Q9Y2W1 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
THRAP3Q9Y2W1 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
THRAP3Q9Y2W1 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
THRAP3Q9Y2W1 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
THRAP3Q9Y2W1 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
THRAP3Q9Y2W1 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
THRAP3Q9Y2W1 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
THRAP3Q9Y2W1 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
THRAP3Q9Y2W1 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
THRAP3Q9Y2W1 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
THRAP3Q9Y2W1 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
THRAP3Q9Y2W1 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
THRAP3Q9Y2W1 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
THRAP3Q9Y2W1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
THRAP3Q9Y2W1 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
THRAP3Q9Y2W1 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
THRAP3Q9Y2W1 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
THRAP3Q9Y2W1 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
THRAP3Q9Y2W1 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
THRAP3Q9Y2W1 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
THRAP3Q9Y2W1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
THRAP3Q9Y2W1 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
THRAP3Q9Y2W1 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
THRAP3Q9Y2W1 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
THRAP3Q9Y2W1 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
THRAP3Q9Y2W1 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
THRAP3Q9Y2W1 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
THRAP3Q9Y2W1 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
THRAP3Q9Y2W1 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
THRAP3Q9Y2W1 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
THRAP3Q9Y2W1 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
THRAP3Q9Y2W1 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
THRAP3Q9Y2W1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
THRAP3Q9Y2W1 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
THRAP3Q9Y2W1 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
THRAP3Q9Y2W1 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms