Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQB3

CTNND2, Catenin delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNND2Q9UQB3 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms