Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SHOC2Q9UQ13 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
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