Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PHF8Q9UPP1 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PHF8Q9UPP1 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PHF8Q9UPP1 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PHF8Q9UPP1 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PHF8Q9UPP1 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PHF8Q9UPP1 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PHF8Q9UPP1 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PHF8Q9UPP1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PHF8Q9UPP1 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PHF8Q9UPP1 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PHF8Q9UPP1 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PHF8Q9UPP1 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PHF8Q9UPP1 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PHF8Q9UPP1 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PHF8Q9UPP1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PHF8Q9UPP1 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PHF8Q9UPP1 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PHF8Q9UPP1 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PHF8Q9UPP1 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PHF8Q9UPP1 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PHF8Q9UPP1 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PHF8Q9UPP1 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PHF8Q9UPP1 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PHF8Q9UPP1 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PHF8Q9UPP1 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PHF8Q9UPP1 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
PHF8Q9UPP1 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
PHF8Q9UPP1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PHF8Q9UPP1 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PHF8Q9UPP1 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PHF8Q9UPP1 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PHF8Q9UPP1 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PHF8Q9UPP1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
PHF8Q9UPP1 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PHF8Q9UPP1 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PHF8Q9UPP1 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PHF8Q9UPP1 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PHF8Q9UPP1 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PHF8Q9UPP1 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PHF8Q9UPP1 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PHF8Q9UPP1 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PHF8Q9UPP1 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PHF8Q9UPP1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PHF8Q9UPP1 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PHF8Q9UPP1 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PHF8Q9UPP1 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PHF8Q9UPP1 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PHF8Q9UPP1 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PHF8Q9UPP1 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PHF8Q9UPP1 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PHF8Q9UPP1 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PHF8Q9UPP1 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PHF8Q9UPP1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PHF8Q9UPP1 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PHF8Q9UPP1 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PHF8Q9UPP1 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PHF8Q9UPP1 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PHF8Q9UPP1 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PHF8Q9UPP1 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PHF8Q9UPP1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PHF8Q9UPP1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PHF8Q9UPP1 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PHF8Q9UPP1 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PHF8Q9UPP1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PHF8Q9UPP1 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PHF8Q9UPP1 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PHF8Q9UPP1 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PHF8Q9UPP1 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PHF8Q9UPP1 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PHF8Q9UPP1 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PHF8Q9UPP1 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PHF8Q9UPP1 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PHF8Q9UPP1 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PHF8Q9UPP1 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PHF8Q9UPP1 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PHF8Q9UPP1 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PHF8Q9UPP1 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PHF8Q9UPP1 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PHF8Q9UPP1 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PHF8Q9UPP1 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PHF8Q9UPP1 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PHF8Q9UPP1 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PHF8Q9UPP1 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PHF8Q9UPP1 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PHF8Q9UPP1 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PHF8Q9UPP1 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PHF8Q9UPP1 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PHF8Q9UPP1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PHF8Q9UPP1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PHF8Q9UPP1 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PHF8Q9UPP1 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PHF8Q9UPP1 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PHF8Q9UPP1 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PHF8Q9UPP1 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PHF8Q9UPP1 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PHF8Q9UPP1 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PHF8Q9UPP1 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PHF8Q9UPP1 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PHF8Q9UPP1 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms