Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULU4

ZMYND8, Protein kinase C-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZMYND8Q9ULU4 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZMYND8Q9ULU4 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZMYND8Q9ULU4 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZMYND8Q9ULU4 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZMYND8Q9ULU4 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZMYND8Q9ULU4 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ZMYND8Q9ULU4 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZMYND8Q9ULU4 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZMYND8Q9ULU4 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZMYND8Q9ULU4 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZMYND8Q9ULU4 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ZMYND8Q9ULU4 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZMYND8Q9ULU4 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZMYND8Q9ULU4 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZMYND8Q9ULU4 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZMYND8Q9ULU4 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZMYND8Q9ULU4 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZMYND8Q9ULU4 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZMYND8Q9ULU4 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZMYND8Q9ULU4 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZMYND8Q9ULU4 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZMYND8Q9ULU4 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZMYND8Q9ULU4 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZMYND8Q9ULU4 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZMYND8Q9ULU4 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZMYND8Q9ULU4 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZMYND8Q9ULU4 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZMYND8Q9ULU4 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZMYND8Q9ULU4 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZMYND8Q9ULU4 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZMYND8Q9ULU4 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZMYND8Q9ULU4 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZMYND8Q9ULU4 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZMYND8Q9ULU4 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZMYND8Q9ULU4 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZMYND8Q9ULU4 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZMYND8Q9ULU4 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZMYND8Q9ULU4 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZMYND8Q9ULU4 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZMYND8Q9ULU4 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZMYND8Q9ULU4 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZMYND8Q9ULU4 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZMYND8Q9ULU4 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZMYND8Q9ULU4 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZMYND8Q9ULU4 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZMYND8Q9ULU4 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZMYND8Q9ULU4 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZMYND8Q9ULU4 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ZMYND8Q9ULU4 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZMYND8Q9ULU4 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ZMYND8Q9ULU4 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZMYND8Q9ULU4 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZMYND8Q9ULU4 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ZMYND8Q9ULU4 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZMYND8Q9ULU4 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZMYND8Q9ULU4 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZMYND8Q9ULU4 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZMYND8Q9ULU4 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZMYND8Q9ULU4 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZMYND8Q9ULU4 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZMYND8Q9ULU4 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZMYND8Q9ULU4 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZMYND8Q9ULU4 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZMYND8Q9ULU4 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZMYND8Q9ULU4 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZMYND8Q9ULU4 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZMYND8Q9ULU4 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZMYND8Q9ULU4 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZMYND8Q9ULU4 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ZMYND8Q9ULU4 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZMYND8Q9ULU4 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZMYND8Q9ULU4 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ZMYND8Q9ULU4 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZMYND8Q9ULU4 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZMYND8Q9ULU4 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ZMYND8Q9ULU4 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ZMYND8Q9ULU4 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZMYND8Q9ULU4 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZMYND8Q9ULU4 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZMYND8Q9ULU4 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZMYND8Q9ULU4 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZMYND8Q9ULU4 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZMYND8Q9ULU4 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZMYND8Q9ULU4 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZMYND8Q9ULU4 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZMYND8Q9ULU4 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZMYND8Q9ULU4 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZMYND8Q9ULU4 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZMYND8Q9ULU4 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZMYND8Q9ULU4 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZMYND8Q9ULU4 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZMYND8Q9ULU4 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZMYND8Q9ULU4 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZMYND8Q9ULU4 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZMYND8Q9ULU4 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZMYND8Q9ULU4 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZMYND8Q9ULU4 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZMYND8Q9ULU4 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZMYND8Q9ULU4 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZMYND8Q9ULU4 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms