Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKT5

FBXO4, F-box only protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO4Q9UKT5 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FBXO4Q9UKT5 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FBXO4Q9UKT5 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FBXO4Q9UKT5 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FBXO4Q9UKT5 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FBXO4Q9UKT5 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FBXO4Q9UKT5 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FBXO4Q9UKT5 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FBXO4Q9UKT5 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
FBXO4Q9UKT5 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FBXO4Q9UKT5 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FBXO4Q9UKT5 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FBXO4Q9UKT5 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
FBXO4Q9UKT5 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FBXO4Q9UKT5 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FBXO4Q9UKT5 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FBXO4Q9UKT5 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FBXO4Q9UKT5 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FBXO4Q9UKT5 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FBXO4Q9UKT5 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FBXO4Q9UKT5 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FBXO4Q9UKT5 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FBXO4Q9UKT5 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
FBXO4Q9UKT5 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
FBXO4Q9UKT5 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
FBXO4Q9UKT5 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms