Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL4

GJD2, Gap junction delta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD2Q9UKL4 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
GJD2Q9UKL4 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GJD2Q9UKL4 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GJD2Q9UKL4 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GJD2Q9UKL4 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GJD2Q9UKL4 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GJD2Q9UKL4 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GJD2Q9UKL4 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GJD2Q9UKL4 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GJD2Q9UKL4 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GJD2Q9UKL4 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GJD2Q9UKL4 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GJD2Q9UKL4 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GJD2Q9UKL4 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GJD2Q9UKL4 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GJD2Q9UKL4 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GJD2Q9UKL4 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GJD2Q9UKL4 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJD2Q9UKL4 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJD2Q9UKL4 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJD2Q9UKL4 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJD2Q9UKL4 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJD2Q9UKL4 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJD2Q9UKL4 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJD2Q9UKL4 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJD2Q9UKL4 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJD2Q9UKL4 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJD2Q9UKL4 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJD2Q9UKL4 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GJD2Q9UKL4 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJD2Q9UKL4 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJD2Q9UKL4 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJD2Q9UKL4 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJD2Q9UKL4 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJD2Q9UKL4 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJD2Q9UKL4 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJD2Q9UKL4 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJD2Q9UKL4 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJD2Q9UKL4 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJD2Q9UKL4 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJD2Q9UKL4 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJD2Q9UKL4 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJD2Q9UKL4 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJD2Q9UKL4 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJD2Q9UKL4 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GJD2Q9UKL4 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJD2Q9UKL4 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJD2Q9UKL4 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GJD2Q9UKL4 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJD2Q9UKL4 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJD2Q9UKL4 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJD2Q9UKL4 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJD2Q9UKL4 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJD2Q9UKL4 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJD2Q9UKL4 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJD2Q9UKL4 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJD2Q9UKL4 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GJD2Q9UKL4 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJD2Q9UKL4 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJD2Q9UKL4 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJD2Q9UKL4 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJD2Q9UKL4 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms