Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK99

FBXO3, F-box only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO3Q9UK99 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FBXO3Q9UK99 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FBXO3Q9UK99 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FBXO3Q9UK99 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FBXO3Q9UK99 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
FBXO3Q9UK99 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FBXO3Q9UK99 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FBXO3Q9UK99 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FBXO3Q9UK99 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FBXO3Q9UK99 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FBXO3Q9UK99 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FBXO3Q9UK99 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FBXO3Q9UK99 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FBXO3Q9UK99 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
FBXO3Q9UK99 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FBXO3Q9UK99 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FBXO3Q9UK99 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FBXO3Q9UK99 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FBXO3Q9UK99 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FBXO3Q9UK99 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FBXO3Q9UK99 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FBXO3Q9UK99 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FBXO3Q9UK99 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FBXO3Q9UK99 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FBXO3Q9UK99 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FBXO3Q9UK99 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FBXO3Q9UK99 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FBXO3Q9UK99 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FBXO3Q9UK99 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FBXO3Q9UK99 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FBXO3Q9UK99 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FBXO3Q9UK99 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FBXO3Q9UK99 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FBXO3Q9UK99 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FBXO3Q9UK99 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FBXO3Q9UK99 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FBXO3Q9UK99 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FBXO3Q9UK99 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FBXO3Q9UK99 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
FBXO3Q9UK99 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FBXO3Q9UK99 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FBXO3Q9UK99 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FBXO3Q9UK99 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FBXO3Q9UK99 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FBXO3Q9UK99 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FBXO3Q9UK99 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
FBXO3Q9UK99 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FBXO3Q9UK99 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FBXO3Q9UK99 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FBXO3Q9UK99 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FBXO3Q9UK99 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FBXO3Q9UK99 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FBXO3Q9UK99 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FBXO3Q9UK99 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FBXO3Q9UK99 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FBXO3Q9UK99 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FBXO3Q9UK99 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FBXO3Q9UK99 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FBXO3Q9UK99 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FBXO3Q9UK99 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FBXO3Q9UK99 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FBXO3Q9UK99 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FBXO3Q9UK99 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
FBXO3Q9UK99 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FBXO3Q9UK99 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FBXO3Q9UK99 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FBXO3Q9UK99 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FBXO3Q9UK99 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FBXO3Q9UK99 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FBXO3Q9UK99 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FBXO3Q9UK99 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FBXO3Q9UK99 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FBXO3Q9UK99 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FBXO3Q9UK99 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
FBXO3Q9UK99 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FBXO3Q9UK99 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
FBXO3Q9UK99 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
FBXO3Q9UK99 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FBXO3Q9UK99 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FBXO3Q9UK99 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FBXO3Q9UK99 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FBXO3Q9UK99 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FBXO3Q9UK99 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FBXO3Q9UK99 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FBXO3Q9UK99 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FBXO3Q9UK99 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FBXO3Q9UK99 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FBXO3Q9UK99 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FBXO3Q9UK99 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FBXO3Q9UK99 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FBXO3Q9UK99 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FBXO3Q9UK99 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FBXO3Q9UK99 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FBXO3Q9UK99 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FBXO3Q9UK99 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FBXO3Q9UK99 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FBXO3Q9UK99 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FBXO3Q9UK99 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FBXO3Q9UK99 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FBXO3Q9UK99 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms