Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RABGEF1Q9UJ41 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RABGEF1Q9UJ41 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
RABGEF1Q9UJ41 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RABGEF1Q9UJ41 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RABGEF1Q9UJ41 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RABGEF1Q9UJ41 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RABGEF1Q9UJ41 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RABGEF1Q9UJ41 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RABGEF1Q9UJ41 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RABGEF1Q9UJ41 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RABGEF1Q9UJ41 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
RABGEF1Q9UJ41 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RABGEF1Q9UJ41 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RABGEF1Q9UJ41 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RABGEF1Q9UJ41 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RABGEF1Q9UJ41 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RABGEF1Q9UJ41 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RABGEF1Q9UJ41 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RABGEF1Q9UJ41 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RABGEF1Q9UJ41 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RABGEF1Q9UJ41 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
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RABGEF1Q9UJ41 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RABGEF1Q9UJ41 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RABGEF1Q9UJ41 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
RABGEF1Q9UJ41 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RABGEF1Q9UJ41 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RABGEF1Q9UJ41 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
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RABGEF1Q9UJ41 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RABGEF1Q9UJ41 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RABGEF1Q9UJ41 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RABGEF1Q9UJ41 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RABGEF1Q9UJ41 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
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RABGEF1Q9UJ41 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RABGEF1Q9UJ41 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RABGEF1Q9UJ41 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
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RABGEF1Q9UJ41 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RABGEF1Q9UJ41 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
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RABGEF1Q9UJ41 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RABGEF1Q9UJ41 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RABGEF1Q9UJ41 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
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RABGEF1Q9UJ41 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
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RABGEF1Q9UJ41 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RABGEF1Q9UJ41 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RABGEF1Q9UJ41 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
RABGEF1Q9UJ41 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RABGEF1Q9UJ41 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RABGEF1Q9UJ41 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RABGEF1Q9UJ41 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RABGEF1Q9UJ41 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RABGEF1Q9UJ41 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RABGEF1Q9UJ41 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RABGEF1Q9UJ41 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RABGEF1Q9UJ41 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RABGEF1Q9UJ41 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RABGEF1Q9UJ41 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RABGEF1Q9UJ41 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RABGEF1Q9UJ41 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RABGEF1Q9UJ41 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
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