Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIL8

PHF11, PHD finger protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF11Q9UIL8 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PHF11Q9UIL8 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHF11Q9UIL8 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHF11Q9UIL8 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHF11Q9UIL8 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHF11Q9UIL8 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHF11Q9UIL8 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHF11Q9UIL8 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHF11Q9UIL8 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHF11Q9UIL8 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHF11Q9UIL8 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHF11Q9UIL8 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHF11Q9UIL8 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHF11Q9UIL8 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHF11Q9UIL8 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHF11Q9UIL8 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHF11Q9UIL8 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHF11Q9UIL8 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHF11Q9UIL8 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHF11Q9UIL8 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PHF11Q9UIL8 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHF11Q9UIL8 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHF11Q9UIL8 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHF11Q9UIL8 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PHF11Q9UIL8 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHF11Q9UIL8 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHF11Q9UIL8 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHF11Q9UIL8 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms