Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHORDC1Q9UHD1 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHORDC1Q9UHD1 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHORDC1Q9UHD1 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHORDC1Q9UHD1 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHORDC1Q9UHD1 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHORDC1Q9UHD1 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHORDC1Q9UHD1 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHORDC1Q9UHD1 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHORDC1Q9UHD1 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHORDC1Q9UHD1 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHORDC1Q9UHD1 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHORDC1Q9UHD1 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHORDC1Q9UHD1 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHORDC1Q9UHD1 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHORDC1Q9UHD1 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHORDC1Q9UHD1 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHORDC1Q9UHD1 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHORDC1Q9UHD1 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHORDC1Q9UHD1 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHORDC1Q9UHD1 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHORDC1Q9UHD1 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHORDC1Q9UHD1 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHORDC1Q9UHD1 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHORDC1Q9UHD1 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHORDC1Q9UHD1 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHORDC1Q9UHD1 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHORDC1Q9UHD1 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHORDC1Q9UHD1 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHORDC1Q9UHD1 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHORDC1Q9UHD1 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHORDC1Q9UHD1 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHORDC1Q9UHD1 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHORDC1Q9UHD1 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHORDC1Q9UHD1 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHORDC1Q9UHD1 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHORDC1Q9UHD1 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHORDC1Q9UHD1 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHORDC1Q9UHD1 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHORDC1Q9UHD1 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHORDC1Q9UHD1 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHORDC1Q9UHD1 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHORDC1Q9UHD1 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHORDC1Q9UHD1 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHORDC1Q9UHD1 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHORDC1Q9UHD1 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHORDC1Q9UHD1 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHORDC1Q9UHD1 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHORDC1Q9UHD1 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHORDC1Q9UHD1 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHORDC1Q9UHD1 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHORDC1Q9UHD1 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHORDC1Q9UHD1 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHORDC1Q9UHD1 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHORDC1Q9UHD1 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHORDC1Q9UHD1 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHORDC1Q9UHD1 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHORDC1Q9UHD1 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CHORDC1Q9UHD1 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHORDC1Q9UHD1 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHORDC1Q9UHD1 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHORDC1Q9UHD1 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHORDC1Q9UHD1 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHORDC1Q9UHD1 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CHORDC1Q9UHD1 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHORDC1Q9UHD1 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHORDC1Q9UHD1 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHORDC1Q9UHD1 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHORDC1Q9UHD1 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHORDC1Q9UHD1 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHORDC1Q9UHD1 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHORDC1Q9UHD1 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CHORDC1Q9UHD1 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHORDC1Q9UHD1 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHORDC1Q9UHD1 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHORDC1Q9UHD1 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHORDC1Q9UHD1 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHORDC1Q9UHD1 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHORDC1Q9UHD1 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHORDC1Q9UHD1 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHORDC1Q9UHD1 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHORDC1Q9UHD1 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHORDC1Q9UHD1 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHORDC1Q9UHD1 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHORDC1Q9UHD1 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHORDC1Q9UHD1 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHORDC1Q9UHD1 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHORDC1Q9UHD1 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHORDC1Q9UHD1 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHORDC1Q9UHD1 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHORDC1Q9UHD1 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHORDC1Q9UHD1 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHORDC1Q9UHD1 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHORDC1Q9UHD1 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHORDC1Q9UHD1 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHORDC1Q9UHD1 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHORDC1Q9UHD1 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHORDC1Q9UHD1 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHORDC1Q9UHD1 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHORDC1Q9UHD1 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms