Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU5

HMGXB4, HMG domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB4Q9UGU5 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HMGXB4Q9UGU5 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HMGXB4Q9UGU5 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HMGXB4Q9UGU5 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HMGXB4Q9UGU5 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HMGXB4Q9UGU5 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HMGXB4Q9UGU5 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
HMGXB4Q9UGU5 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HMGXB4Q9UGU5 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HMGXB4Q9UGU5 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HMGXB4Q9UGU5 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HMGXB4Q9UGU5 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HMGXB4Q9UGU5 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HMGXB4Q9UGU5 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HMGXB4Q9UGU5 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HMGXB4Q9UGU5 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HMGXB4Q9UGU5 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HMGXB4Q9UGU5 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HMGXB4Q9UGU5 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
HMGXB4Q9UGU5 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HMGXB4Q9UGU5 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HMGXB4Q9UGU5 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HMGXB4Q9UGU5 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HMGXB4Q9UGU5 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HMGXB4Q9UGU5 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HMGXB4Q9UGU5 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HMGXB4Q9UGU5 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HMGXB4Q9UGU5 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HMGXB4Q9UGU5 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HMGXB4Q9UGU5 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HMGXB4Q9UGU5 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HMGXB4Q9UGU5 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HMGXB4Q9UGU5 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HMGXB4Q9UGU5 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HMGXB4Q9UGU5 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HMGXB4Q9UGU5 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HMGXB4Q9UGU5 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HMGXB4Q9UGU5 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HMGXB4Q9UGU5 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HMGXB4Q9UGU5 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HMGXB4Q9UGU5 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HMGXB4Q9UGU5 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HMGXB4Q9UGU5 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HMGXB4Q9UGU5 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HMGXB4Q9UGU5 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HMGXB4Q9UGU5 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HMGXB4Q9UGU5 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HMGXB4Q9UGU5 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
HMGXB4Q9UGU5 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HMGXB4Q9UGU5 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HMGXB4Q9UGU5 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HMGXB4Q9UGU5 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
HMGXB4Q9UGU5 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HMGXB4Q9UGU5 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HMGXB4Q9UGU5 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HMGXB4Q9UGU5 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HMGXB4Q9UGU5 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HMGXB4Q9UGU5 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
HMGXB4Q9UGU5 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HMGXB4Q9UGU5 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HMGXB4Q9UGU5 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HMGXB4Q9UGU5 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HMGXB4Q9UGU5 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HMGXB4Q9UGU5 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HMGXB4Q9UGU5 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HMGXB4Q9UGU5 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HMGXB4Q9UGU5 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HMGXB4Q9UGU5 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HMGXB4Q9UGU5 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HMGXB4Q9UGU5 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HMGXB4Q9UGU5 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HMGXB4Q9UGU5 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HMGXB4Q9UGU5 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HMGXB4Q9UGU5 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HMGXB4Q9UGU5 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HMGXB4Q9UGU5 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HMGXB4Q9UGU5 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HMGXB4Q9UGU5 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HMGXB4Q9UGU5 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HMGXB4Q9UGU5 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HMGXB4Q9UGU5 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
HMGXB4Q9UGU5 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HMGXB4Q9UGU5 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HMGXB4Q9UGU5 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HMGXB4Q9UGU5 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HMGXB4Q9UGU5 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HMGXB4Q9UGU5 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
HMGXB4Q9UGU5 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HMGXB4Q9UGU5 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HMGXB4Q9UGU5 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HMGXB4Q9UGU5 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HMGXB4Q9UGU5 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
HMGXB4Q9UGU5 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HMGXB4Q9UGU5 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HMGXB4Q9UGU5 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HMGXB4Q9UGU5 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HMGXB4Q9UGU5 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
HMGXB4Q9UGU5 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HMGXB4Q9UGU5 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HMGXB4Q9UGU5 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms