Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCF2Q9UG63 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCF2Q9UG63 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCF2Q9UG63 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCF2Q9UG63 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCF2Q9UG63 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCF2Q9UG63 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCF2Q9UG63 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCF2Q9UG63 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ABCF2Q9UG63 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ABCF2Q9UG63 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ABCF2Q9UG63 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ABCF2Q9UG63 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ABCF2Q9UG63 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ABCF2Q9UG63 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ABCF2Q9UG63 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ABCF2Q9UG63 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ABCF2Q9UG63 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ABCF2Q9UG63 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ABCF2Q9UG63 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ABCF2Q9UG63 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ABCF2Q9UG63 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ABCF2Q9UG63 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ABCF2Q9UG63 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ABCF2Q9UG63 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ABCF2Q9UG63 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ABCF2Q9UG63 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABCF2Q9UG63 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABCF2Q9UG63 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABCF2Q9UG63 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ABCF2Q9UG63 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABCF2Q9UG63 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ABCF2Q9UG63 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABCF2Q9UG63 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABCF2Q9UG63 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABCF2Q9UG63 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABCF2Q9UG63 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABCF2Q9UG63 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABCF2Q9UG63 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABCF2Q9UG63 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABCF2Q9UG63 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABCF2Q9UG63 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCF2Q9UG63 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCF2Q9UG63 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCF2Q9UG63 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCF2Q9UG63 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCF2Q9UG63 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCF2Q9UG63 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCF2Q9UG63 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCF2Q9UG63 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCF2Q9UG63 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCF2Q9UG63 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCF2Q9UG63 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCF2Q9UG63 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCF2Q9UG63 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCF2Q9UG63 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCF2Q9UG63 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCF2Q9UG63 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCF2Q9UG63 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCF2Q9UG63 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCF2Q9UG63 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCF2Q9UG63 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCF2Q9UG63 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCF2Q9UG63 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCF2Q9UG63 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCF2Q9UG63 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCF2Q9UG63 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCF2Q9UG63 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCF2Q9UG63 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCF2Q9UG63 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ABCF2Q9UG63 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ABCF2Q9UG63 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ABCF2Q9UG63 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ABCF2Q9UG63 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ABCF2Q9UG63 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ABCF2Q9UG63 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ABCF2Q9UG63 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ABCF2Q9UG63 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ABCF2Q9UG63 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ABCF2Q9UG63 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ABCF2Q9UG63 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ABCF2Q9UG63 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ABCF2Q9UG63 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ABCF2Q9UG63 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ABCF2Q9UG63 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ABCF2Q9UG63 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ABCF2Q9UG63 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ABCF2Q9UG63 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ABCF2Q9UG63 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ABCF2Q9UG63 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ABCF2Q9UG63 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABCF2Q9UG63 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ABCF2Q9UG63 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABCF2Q9UG63 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABCF2Q9UG63 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABCF2Q9UG63 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ABCF2Q9UG63 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABCF2Q9UG63 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ABCF2Q9UG63 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABCF2Q9UG63 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms